学科创新是我国高等学校中普遍存在的现象，这种现象是我国高等教育发展的必然结果，也是我国大力推行教育创新的必然结果。对这一现象进行深入研究，揭示其内在的规律性，有利于推动高等学校的学科建设，对于繁荣高等教育领域的研究、丰富高等教育理论也具有重要的意义。 本文在全面系统地总结高等学校学科建设和学科创新理论与应用研究现状的基础上，结合湖北高校实施“学科创新工程”，大力开展学科创新的实践经验和成果，对学科创新的理论与方法进行了全面、系统的研究，基本构建了学科创新的理论与方法体系。 全文遵循以下研究逻辑体系：首先，研究学科创新的若干基本理论问题，形成学科创新的基本理论体系，这是全文的逻辑起点。然后，对组织创新、制度创新、特色和优势学科体系的构建等问题进行递进式研究，形成了学科创新的方法论。最后，研究服务于社会发展的学科建设问题，这是有关学科理论与方法研究的归属问题，也是全文的逻辑终点。 以下是本文的主要研究内容和形成的主要认识：一、系统研究了学科创新若干基本理论问题。由于国内对这一问题的研究尚处于起步阶段，研究成果较少，因此，要想构建一个较完整的理论体系确实有相当的难度。尽管如此，本文仍在前人工作的基础上，从学科创新的内涵、特点、原则等方面展开研究。取得了以下研究成果： 1.界定了学科创新的概念，阐释了学科创新的意义，提出了学科创新的主体，并通过与教育创新、学科建设的比较分析，深化对学科创新概念的理解。 2.提出并全面分析了学科创新的四个特点，即层次性、综合性、系统性、实践性。这是本文研究的一个难点，也是一个创新点。本文认为，学科创新的层次性由学科的层次性所决定，首先表现为在不同学科层次上的创新，其次是在同一层次内部、上下层次之间，学科创新的内容、形式上也应是有差别的，第三是从学科的行政级别来看，不同级别的学科其创新目标和重点具有差别。学科创新的综合性表现为学科发展的高度综合性、学科内涵创新的综合性、学校整体学科结构布局的综合性。学科创新是一个系统工程。其系统性首先由学科本身结构的系统性所决定，其次还包括学科发展的外部环境要素，如高校内部建立的学科组织结构、制度体系、学科生态等。可以说，学科内部和外部诸要素的总和构成了学科创新的系统性，或者说学科创新系统。学科创新的实践性是指学科创新必须立足于学科建设的实践，学科创新的成果要能为学科建设实践所检验。 3.提出并系统分析了学科创新的三个基本原则，即遵循科学发展观、学科发展规律、科技发展规律。遵循科学发展观，就是要坚持以人为本，使学科做到全面、协调、可持续发展。学科发展规律，是指学科发展应与社会需求相适应，学科发展是有序的、在连续性中是有阶段性的，学科发展是不均衡和有差异的，学科创新遵循这些规律，就是要按照社会需要有所为、有所不为，在注重投入的同时，更加注重产出。遵循科学发展规律，就是要按照“科学=技术=生产”双向来复型模式、“五联一中心”规律和“智力优先”律的要求，大力推进产学研，坚持服务社会经济和社会发展，把提高学术队伍整体水平和能力、培养知识面广、能力强、素质高的高级专门人才摆在突出位置。 二、系统研究了学科创新的方法论问题。主要包括学科组织创新、制度创新、特色和优势鲜明的学科体系构建三个有机组成的部分。这几部分主要结合湖北高校的实践来进行研究，以增强说服力和指导性。 1.关于学科组织创新的方法问题，本文首先对一般组织理论和高等教育组织理论进行了概要阐述，然后分析了高校的学科组织结构现状，并对湖北高校的组织创新及特征进行了归纳和剖析。在此基础上，结合矩阵组织结构一般理论，构建了二维矩阵式学科组织结构模型，这是本文的又一个创新点。二维矩阵式学科组织结构模型从纵向上看是校-院(系)-学科三级管理、重点在院系的学科导向组织模式，其基层组织是学科，而不是传统的专业教研室。从横向上看是由项目负责人实施管理的项目导向组织模式。其基本单元是项目组。项目组的表现形式、组建方式和存在方式具有多样化特征。 2.关于学科制度创新的方法问题，本文借用经济学后发优势理论，详细分析了制度创新的后发优势和以制度创新打造学科后发优势的意义，并对湖北高校开展制度创新的实践进行了典型性分析。以制度创新打造学科后发优势的观点，是本文的第三个创新点。所谓以制度创新打造学科后发优势，是指整体或部分学科发展水平相对较低的高等学校，由于直接借鉴国内外高水平大学成熟的学科管理制度及实施经验，并在此基础上创造更好的学科建设和管理制度，可以较快地优化学科结构，迅速缩小乃至最终消除自己与高水平大学在学科建设方面的差距，从而实现学科建设的跨越式发展。 3、关于构建特色和优势鲜明的学科体系的方法问题，本文通过分析特色与优势、学科特色与学科优势的关系以及学科的特色与主流的关系，结合湖北高校的实践经验，系统分析了科学规划、组建优势特色学科群，以及通过交叉、联合和以新技术改造、提升等方式凝炼学科方向、催生特色学科的方法和途径。其中对于学科的特色与主流的关系分析，是这一部分的一个亮点。 三、深入研究了服务地方经济，促进学科发展的问题。主要包括：通过对湖北高校有关人才培养、科技项目研究和成果、高新技术产业和科技成果转化等资料的统计分析，阐述学科建设与地方经济发展的关系；通过理论分析，阐述学科建设服务地方经济发展的重要意义；通过对湖北高校典型经验或模式的介绍，对在服务地方经济中发展学科这一有效途径进行实证分析，以及对社会导向与学术导向相统一、科学有效的服务机制、学科的协作和特色化等应注意的问题进行探讨。