旨在建立基于科技创新内生机理及运行机制(STIEM)的科学出版理论框架。通过希腊哲学发展轨迹,希腊时期和文艺复兴时期的4部经典科学著作,认识论发展轨迹,考察世界本原结构、知识框架结构、知识本原结构,建立科学存在原型结构(PSSB)。通过PSSB行为解析,构建起科学研究能力体系(SRAS),以科学发现逻辑逐层逐点争取科学优先权(SP),提出科学优先权结构起点效应(SSPESP)。在SSPESP驱动下,SRAS基于PSSB,自主发起科学实践行为,自主导构SP,提出STIEM。通过基于PSSB的STIEM计数语言、交流语言与记录语言(CL-STIEM-PSSB, IL-STIEM-PSSB, NL-STIEM-PSSB)的联构,建立基于PSSB的科技创新分类模型(CM-STI-PSSB),实现基于PSSB的科技创新行为表征。通过基于PSSB的STIEM传播语言(TL-STIEM-PSSB)组建基于STIEM的SP表征模型(SP-DM-STIEM)。通过面向科学创新的SRAS可视化模型(SARS-VM-STI)和面向科技创新的SRAS绩效评估模型(SARS-PEM-STI),实现STIEM和SRAS可视化。通过NSFC机械学科SRAS的绩效考察,证明STIEM和SRAS客观存在。认为科学信息本体结构(OSSI)是STIEM的运行机制,提出其结构划分。研究科学信息生成模块,通过引导结构及复合运行机制,以及面向PSSB的科技创新筛选模型(SM-STIEM-PSSB),实现科学结构数据变构及创新数据筛选。讨论科学信息发布模块功能及结构。通过科学期刊出版史和历史上上3次大规模科学翻译运动实证了科学信息发布机制客体存在,归纳出科学信息发布机制的两种工作模式。通过科学优先权标志载体模型构形模板(CT-SPICM)和基于PSSB的STIEM科学优先权传播语言(TL-SP-STIEM-PSSB),建立科学优先权标志载体模型(SPICM)。通过科学话语权标志行为分层和科学话语权标志行为空间(SDPIBS),建立科学话语权标志载体模型(SDPICM)。通过科学优先权标志数据分形置位机制(M-FP-SPID)实现科学优先权标志数据向SDPIBS抛射,构建起科学信息标志平台(SIIP)。通过基于OSSI的科学信息传递路径模型(SITPM)分析,发现在寻找科学研究对象时,存在科学话语外溢通道(ASDS),可以形成科学话语外溢现象(PSDS)。通过对于基于科学话语外溢现象的国际贸易规则(ITR-PSDS)对于“中国制造”损害的考察,确认PSDS的存在,证明OSSI对于SRAS运行机制的不可动摇性。基于OSSI变构路径(TP-OSSI),通过基于PSSB的STIEM科学优先权传播语言(TL-SP-STIEM-PSSB)和基于PSSB的STIEM科学话语权传播语言(TL-SDP-STIEM-PSSB),在科学信息标志载体(SIIC)上建立面向科学优先权标志的科学信息标志体制(SIIS-SPI),证明科学出版是OSSI的工作体制。通过希腊时期和文艺复兴时期的4部经典科学著作,实证了科学优先权标志载体构形模板的历史存在；通过科学著作《机器人操作》和科学期刊《数字制造科学》,实证了科学著作构形模板和正式论文构形模板的现实存在,发现CT-SPIDM就是PSSD。基于PSSB的STIEM科学优先权快速标志传播语言(TL-SP-CI-STIEM-PSSB)分类,建立科学话语权快速标志行为空间(SDP-CIBS),通过matlab.模拟出SDP-CIBS的4种形式。认为科学期刊是SDP-CIBS的物理实现形式,通过matlab.模拟,找到了科学期刊的15种形式。通过《数字制造科学》创刊,实验了科学信息标志载体目标定位行为(PWB-SIIC)的实现方法。以《数字制造科学》传播语言为核心,实验证了科学信息标志载体发布作业行为(GSB-SIIC)方法。证明科学出版可以通过构建CT-SPICM、TL-SP-STIEM-PSSB、SDP-CIBS得以工程化实现。围绕以上研究展开科学实验,创办了科学期刊《数字制造科学》、著作了科学著作《NSFC机械科学基础研究20年》、编辑出版了科学著作《机器人操作》。((NSFC机械科学基础研究20年》荣获首届湖北出版政府奖、《机器人操作》荣获第二届湖北图书奖,《数字制造科学》荣获湖北省第五届优秀期刊奖,并进入中国科技论文统计源。建立基于STIEM的科学出版科学存在原型结构。