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近年来,水环境恶化和种质退化导致凡纳滨对虾病害频发、大量抗生素引起的抗药性及药物残留等问题,给养殖户造成巨大的经济损失,严重影响了对虾养殖业的健康稳定发展。为了解决养殖病害和食品安全等诸多矛盾,寻找新的绿色环保的抗生素替代品成为目前研究的热点。本研究采用高通量测序技术,分析对虾肠道和养殖水体中主要菌群组成,筛选优势微生物制备益生菌,饲养凡纳滨对虾,研究其对凡纳滨对虾免疫功能及肠道菌群的影响,主要结果与结论如下:1.采用高通量测序技术,分析了凡纳滨对虾肠道和养殖水体的菌群组成,确定对虾肠道和养殖水体的主要菌群是变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、后壁菌门(Firmicutes),次要菌群为衣原体门(Chlamydiae)、浮霉菌门(Planctomycetes)。各类群所占的比例不同,凡纳滨对虾肠道中各菌群所占比例:变形菌门42.44%、拟杆菌门46.57%、放线菌门2.21%、厚壁菌门4.57%、衣原体门0.23%、浮霉菌门0.03%;养殖水体各菌群所占比例:变形菌门57.74%、拟杆菌门18.27%、放线菌门8.42%、厚壁菌门8.59%、衣原体门0.58%、浮霉菌门0.15%、绿湾菌门0.05%、硝化螺旋菌门0.03%。绿湾菌门(Chloroflexi)和硝化螺旋菌门(Nitrospirae)为养殖水体特有类群。2.用类芽孢杆菌和双歧杆菌作为益生菌,添加到凡纳滨对虾的饲料中,饲养4周,采用南京建成试剂盒和变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,研究益生菌对凡纳滨对虾免疫功能及肠道菌群的影响,结果表明,益生菌能够明显提高对虾血清过氧化物酶、超氧化物歧化酶、一氧化氮合酶、酸性磷酸酶和碱性磷酸酶的活性,明显改善对虾肠道的菌群组成,从而提高对虾抵抗疾病的能力。