为加强我国博物馆建设，引导和支持地方重点博物馆向国际先进行列迈进，国家文物局要求建立起适合国家级博物馆的评估指标体系，并每年对国家级馆的运行情况进行评估。本论文首先对于非营利组织运行评估的主要理论进行梳理，并对国内外的博物馆运行评估案例进行研究；其次，通过对国家对于国家级博物馆的相关要求、国际知名博物馆的共通之处和我国国家级馆的现状进行研究，明确我国国家级博物馆的基本定位；最后，在明确国家级博物馆定位的基础上借鉴非营利组织绩效评估模型，从效率、效果和效能三个层面出发，设计并提出国家级博物馆运行评估的指标体系，包括指标体系框架、二级指标和考察要点、指标权重。本文构建的评估指标体系旨在鼓励和规范国家级博物馆的运行评估，实现以评促建、以评促改的目的，推动国家级博物馆的发展，同时为国家级博物馆的发展明确方向。