扩增片段长度多态性技术(AFLP)是基于选择性扩增完全酶切消化后的基因组DNA片段.该技术的运用不需要预知基因组的序列特征,具有较高的多态分辨力,可适用于任何来源和各种复杂度的DNAs.AFLP技术被广泛地运用到动物分子生物学的研究中.该文利用简化的AFLP技术从基因水平上对太平洋牡蛎、大连湾牡蛎、褶牡蛎和近江牡蛎进行了初步分类鉴定和遗传多样性分析,探讨了AFLP技术在牡蛎系统分类学上的应用.在16种引物中,筛选了8种引物对四种牡蛎的DNA进行扩增均得到1-10个大小不等的DNA片段,长度大部分在500-2000bp之间.此外,还得到了4条特异性标记(太平洋2条,大连湾和近江牡蛎各1条),可作为种的鉴定.数据处理参照RAPD标记的数据分析方法,计算了四种牡蛎群内遗传多样性参数和种间的遗传距离.DNA序列分析是检测DNA水平多态性最精确的方法,鉴于中国沿岸几种常见牡蛎分类比较混乱的现状,利用PCR技术扩增了大连、青岛、宁波和厦门4个不同地理位置的常见牡蛎16S核糖体RNA和细胞色素氧化酶亚I单位(COI)基因片段,测定得到的基因片段分别长度分别是488bp和649bp.分子标记在牡蛎鉴别与系统分类研究方面,有强大的说服力,如果可以在牡蛎的分类研究中综合形态学、细胞学和分子系统学等多方面的证据,将会对牡蛎的系统分类提供一个更完美的解释.