二倍体月季高密度遗传连锁图谱构建及部分观赏性状遗传分析和QTL定位

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月季是世界上著名的观赏植物之一,因其种类繁多、形态丰富、适应性强而深受大众喜爱。同时,也因其具有连续开花和花香等特异的园艺性状,逐渐成为木本植物研究的模式植物。为了解析月季连续开花等重要性状的遗传基础,本研究以’窄叶藤本月季花’和中国古老月季品种’月月粉’及其F1群体为实验材料,采用主基因+多基因混合遗传模型对表型性状的遗传变异进行了分析,解析了月季观赏性状的遗传规律;通过简化基因组测序技术开发SNP分子标记,构建高密度遗传图谱,并进行QTL分析,挖掘与重要观赏性状紧密关联的分子标记,以期为月季分子标记辅助育种技术的开发奠定基础。主要结论如下:(1)以’窄叶藤本月季花’为母本、’月月粉’为父本杂交获得F1群体,共872株,对其中400株作图群体的24个表型性状进行测定和分析,其中数量性状变异系数为14.40%~62.36%,变异广泛,广义遗传力为46.84%~94.71%;质量性状的多样性指数为0.676~1.378,群体遗传多样性丰富。开花习性与雄蕊瓣化分别符合7:9和1:1的分离比。株高与节间长、刺量、小叶数、复叶长宽、顶叶长呈极显著正相关,花径与花瓣数量、花瓣外延程度、花瓣长、花瓣宽呈极显著正相关。(2)杂交亲本的花色均为粉色,杂交后代群体花色分离广泛,分为5个色系:白色系、粉色系、红色系、红紫色系、墨色系。整理了各色系的参数分布范围,建立了杂交群体色系与色差仪CIELab表色系统L*、a*、b*值的对应关系,实现对花色的定量描述。(3)通过主基因+多基因混合遗传模型分析,确定了杂交群体18个性状的遗传模型,株高、节间长、生长习性、嫩枝显色程度、刺量、顶叶叶基形状和花色的遗传模型为1MG-AD(1对加性-显性主基因控制),复叶长、复叶宽、顶叶长、顶叶宽、顶叶形状、顶叶叶尖形状和花色的遗传模型为OMG(微效多基因控制),花瓣长、花瓣宽和花瓣形状的遗传模型为2MG-ADI(2对加性-显性-上位性主基因控制),花瓣数量的遗传模型为2MG-AD(2对加性-显性主基因控制)。(4)在杂交后代中随机挑选400个单株组成作图群体,通过RAD-seq测序,获得558.96G数据量,碱基质量Q30比例达到89.27%,子代平均覆盖度为25.56%,平均测序深度为2.47X,亲本平均测序深度为41.30X。开发了 4,018,334个多态性标记,最终上图标记45,006个,分布于7个连锁群,总图距840.05cM,标记间平均距离0.019cM,构建了二倍体月季高密度遗传连锁图谱,为目前作图群体最大、上图标记最多、标记间平均距离最小的蔷薇属遗传连锁图谱。该图谱与月月粉基因组有很好的共线性关系。(5)采用复合区间作图法与R/qtl软件检测到与14个性状相关的QTLs位点210个。各性状效应最大的QTLs的LOD值在4.26~15.19之间,解释表型变异率在1.10%~19.87%之间。控制株高、复叶长、花径和花色的主效QTLs的解释表型变异率均大于10%,分别为13.66%、11.57%、19.87%和19.62%。本研究获得的QTLs可为月季表型性状的遗传基础和分子生物学研究提供参考。
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