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选取14株野禽源AIV,以新近发现的A型流感病毒蛋白PB1-F2为研究对象,在完成此14株AIV PB1-F2基因克隆、测序的基础上,对其进行了同源性、遗传进化关系及氨基酸编码特征的比较分析。我们发现H5N1亚型高致病性毒株A/lesser_kestrel/Harbin/194/2007(H5N1) PB1-F2的第37、48、50位氨基酸分别为精氨酸(Arg,R)、脯氨酸(Pro,P)、甘氨酸(Gly,G),与其它13个低致病性毒株均不相同,其分别为谷氨酰胺(Gln,Q)、谷氨酰胺(Gln,Q)、天冬氨酸(Asp,D)。为探讨这一现象,也为了使我们的研究更加全面、深入,从NCBI Influenza Virus Resource中选取1061个AIV毒株的PB1-F2基因序列进一步展开分析,结果表明所有非H9N2亚型AIV：97香港H5N1、其它H5N1及其它亚型AIV在此三个位点上的氨基酸构成存在着较为明显的差异,而且还呈现出了一定的规律和特点；H9N2亚型毒株：表现出了较强的时间和空间分布特征,我们根据H9N2亚型与其它亚型AIV在此三个氨基酸位点上的异同,将其分为H5N1-like型和Other subtypes-like型两大类。针对PB1-F2基因的遗传进化分析表明在其漫长的遗传演化进程中,PB1-F2已经形成了多条遗传进化分支,具体表现为H5N1及香港系毒株较其它AIV存在较远的遗传距离。随机的突变和重组似乎不足以解释这种差异及遗传距离形成的原因,其生物学意义有待于进一步的探讨。