课题组前期从自然发酵的甘薯酸浆中分离一株对淀粉颗粒具有絮凝作用的副干酪乳杆菌L1,副干酪乳杆菌L1能够特异性结合到淀粉颗粒的表面,将淀粉颗凝结到一起变成大的淀粉团,继而加速淀粉的沉降。淀粉在L1絮凝沉降的过程中,淀粉的表观结构、理化性质也发生了变化,所以对L1吸附淀粉颗粒表面目的性进行猜想,通过前期的实验发现L1恰好是淀粉水解乳酸菌ALAB（Amylolytic Lactic Acid Bacteria）,并且发现了与淀粉结合的蛋白,分别为6-磷酸葡萄糖异构酶、糖原合酶、烯醇化酶、D-3-磷酸甘油酸脱氢酶、腺苷酸基琥珀酸合成酶、磷酸丙糖异构酶、延伸因子Tu等,从分子水平上证实副干酪乳杆菌L1具有利用生淀粉的能力。为了具体探明副干酪乳杆菌L1的在基因水平上有哪些与淀粉这类多糖相关的水解酶类的关键基因,分析淀粉的具体代谢途径,利用基因组学测定副干酪乳杆菌L1全基因组序列,绘制其基因图谱利用生物信息学技术对副干酪乳杆菌L1的基因组进行基因注释,寻找与淀粉代谢相关的重要基因并运用CAZY数据库寻找糖苷水解酶家族。1、对副干酪乳杆菌L1进行全基因组测序。对基因组进行了基因预测和基因注释,基因组的基础信息进行了分析,分析结果如下:副干酪乳杆菌L1基因组的基本信息表明,副干酪乳杆菌L1具有1个环形染色体大小为3,121,955bp,平均GC含量为46.14%,分析得到3462个CDSs（基因数目）,其中3088个CDSs位于在染色体上,374个CDSs位于质粒上,染色体和质粒都为环状分子。有9条质粒,大小分别为74,549bp、65,798bp、53,066bp、43,201bp、32,566bp、17,723bp、10,420bp、9,833bp、4,936bp,60个包含几乎所有类型氨基酸底物的t RNA、15个Rrna。GO、COG数据库对副干酪乳杆菌L1进行功能注释,发现L1的基因组中编码了大量与膜运输和碳水化合物代谢相关的功能基因,COG0366中发现了8个与α-淀粉酶相关的基因（L1gene0504、L1gene0609、L1gene0983、L1gene0984、L1gene2095、L1gene2174、L1gene2904、L1p Agene0058）,推测副干酪乳杆菌L1具有代谢淀粉的能力;2、L1基因组中编码了糖酵解、果糖、蔗糖、淀粉的代谢途径所必需的酶系,证实了L1代谢淀粉的能力。并且在副干酪乳杆菌L1的基因组编码中有42个糖苷键水解酶,其中有9个属于GH13家族淀粉水解酶,主要催化裂解以α-1,4-糖苷键连接的寡糖或聚糖,如α-葡萄糖苷酶mal Z、低聚葡萄糖水解酶mal Z、α-淀粉酶amy A和α-1,4-葡聚糖支链酶glg B等。这些酶与副干酪乳杆菌L1利用多种以α/β-糖苷键连接的寡糖和聚糖有重要关联,是其适应植物基底物的重要原因;3、碳水化合物活性酶数据库（CAZy,http://www.cazy.org/）比对结果显示副干酪乳杆菌L1共有105个CAZyme编码基因,其中数量最多的是糖苷水解酶（GHs）42个占全部编码基因的40%,其次为糖基转移酶（GTs）39个占全部编码基因的37.14%,碳水化合物酯酶（CEs）16个占全部编码基因的15.24%,辅助氧化还原酶（AAs）7个占全部编码基因的6.67%,碳水化合物结合模块（CBMs）1个占全部编码基因的0.95%。糖苷水解酶及糖苷转移酶数量的大小决定着聚合底物裂解的关键。基因组编码了42个GH糖苷水解酶家族,其中编码了9个GH13淀粉水解酶家族,这9个GH13淀粉水解酶家族又被区分成5个不同的亚家族,分别为GH1331、GH1329、GH1320、GH139、GH1336家族,主要的任务是水解以α-糖苷键连接的多糖,可以将淀粉、糊精水解成葡萄糖或麦芽糖等还原糖;还发现了基因组编码了4个溶菌酶（Lysozyme）在数据库中为GH25,溶菌酶主要与噬菌体基因有关联,主要是细胞自溶作用。