论文部分内容阅读
背景NK细胞淋巴瘤(NKCL)属于非霍奇金淋巴瘤(NHL)的一种特殊亚型,约占NHL的2%-10%,WHO最新分类将其分为两种亚型:结外NK细胞淋巴瘤,鼻型(extranodal NK/T-cell lymphoma, nasal type,ENKL)和进展期NK细胞白血病/淋巴瘤(aggressive NK-cell leukemia,ANKL),这类疾病大都发生于亚洲和拉丁美洲人群,其恶性细胞大多来源于成熟的NK细胞(CD2+, CD56+,胞质CD3ε+以及EBV+),少部分来源于NK样细胞毒性T细胞(CD56+, EBV+);NK细胞淋巴瘤的大部分肿瘤细胞上可以检测到EB病毒(EBV)的存在,提示EBV在此类淋巴瘤的发病中可能发挥着重要作用;在组织学上以血管破坏、肿瘤坏死与凋亡为其特征表现,因此是一类高度侵袭性疾病。根据病变部位的不同,ENKL可以分为两种主要亚型:鼻腔和鼻以外部位,前者称为鼻腔NK细胞淋巴瘤,后者为鼻型NK细胞淋巴瘤。晚期患者的临床过程进展比较快,尤其是鼻型NK细胞淋巴瘤预后差,与ANKL相似。众所周知,多药耐药(MDR1)基因编码产物P一糖蛋白(P-gp)高表达于ENKL和ANKL肿瘤细胞,故NK细胞淋巴瘤对于传统的含葸环类化疗药物化疗方案的疗效比较差,故NKCL是一种高度侵袭性、对传统化疗方案耐药且预后较差的恶性疾病。但是由于NKCL发病率比较低,而且有地域上的明显差异,所以其病因及发病机制的研究至今尚无定论。近年来,RNA测序技术在肿瘤基因表达谱的研究上发挥了重要作用,尤其是高通量测序技术的出现大大促进了肿瘤诊断技术和治疗手段的发展。通过对某一种癌症的肿瘤组织和正常对照组织进行外显子测序,有关研究已经找到了与卵巢癌、肾癌、胰腺癌、膀胱移行细胞癌及白血病等的发病有关的基因突变[3-7];还有应用测序技术从肿瘤患者血浆中检测肿瘤特异性重排基因来作为生物标记物来提高肿瘤个体化诊断的水平;还可以通过这种生物学标记物来监测治疗后残余病变。其中数字基因表达谱(Digital gene expression, DGE)是从转录组水平对mRNA的表达进行定量的一种高通量测序技术,通过对不同样本进行DGE检测,可以找出差异表达基因,同时可以对差异基因进行分析,从而找出有意义的差异表达基因。DGE被广泛用于各个行业的基础研究,尤其是肿瘤学,可是在NK细胞淋巴瘤方面却没有相关研究。目的通过对正常人NK细胞和两株NK/T细胞淋巴瘤细胞株(YTS和SNK-6)进行DGE检测,构建出1个正常NK细胞两个NK/T细胞淋巴瘤细胞系的DGE文库,并筛选出三个细胞系之间的差异表达基因,明确NK/T细胞淋巴瘤细胞系中常见耐药相关基因的差异表达情况;利用荧光实时定量PCR技术(quantitative Real-time PCR, qPCR)扩增两个耐药相关基因在三个细胞系中的表达,来验证测序分析的准确性,为探讨NK/T细胞淋巴瘤的病因和耐药机制提供实验基础。方法采用DGE检测正常人NK细胞和YTS、SNK-6的数字基因表达谱及差异基因表达;采用荧光实时定量PCR技术(Real-time PCR, qRT-PCR)检测常见的两个耐药相关基因ABCC5和ERBB4的表达水平,以验证测序结果。结果1构建了一个正常NK细胞和两个NK/T细胞淋巴瘤细胞系的数字基因表达谱(Digital gene expression, DGE)文库,筛选出了三个细胞系之间的明显差异表达基因。2Real-time PCR检测DGE中显著差异表达的两个耐药基因ABCC5和ERBB4在三个细胞系中的表达与DGE结果基本一致。结论1NK/T细胞淋巴瘤细胞系与正常NK细胞之间存在大量的显著差异表达基因,这些基因可能与NK/T细胞淋巴瘤的发病、预后、转移、耐药等特征有关。2NK/T细胞淋巴瘤的耐药与多个耐药相关基因的差异表达有关。3DGE检测方法准确可靠,可以为肿瘤相关研究提供实验依据。