肺炎克雷伯菌噬菌体的分离鉴定及基因组分析

来源 :大连理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:WANGYUEWANG
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)是一种革兰氏阴性菌,可以引起坏死性肺炎、肝脓肿,以及呼吸道、泌尿道、伤口和血液感染。肺炎克雷伯菌为条件致病菌,它是肠道及泌尿系统中正常菌群,机体免疫力低下、菌群失调时会引起各种炎症。目前,随着抗生素的广泛使用,多重耐药KP的分离率逐年上升。噬菌体是一种病毒,它侵染并杀灭细菌。噬菌体作为一种抗菌物质,可以特异性识别宿主菌并对其进行裂解。本研究包括肺炎克雷伯菌的分离纯化、噬菌体的分离鉴定及噬菌体全基因组分析。结果分离纯化出6株肺炎克雷伯菌。经检测,这6株KP均具有形成生物被膜的能力,基因组中均携带如I型菌毛相关基因fim、wab G基因等毒力基因和耐药基因,且这6株分离菌均对多种抗生素具有耐药性,均为多重耐药肺炎克雷伯菌。以这6株KP作为宿主菌,经污水富集法从未经处理的医院废水中分离筛选出2株裂解性噬菌体,分别命名为ABTNL-1、ABTNL-2。经宿主谱测定结果显示,噬菌体ABTNL-1、ABTNL-2能裂解两株及以上细菌;透射电镜观察显示,这两株噬菌体形态学均属于有尾噬菌体目、长尾噬菌体科;通过测定最佳感染复数,噬菌体ABTNL-1和ABTNL-2的最佳感染复数分别为0.1和1;通过测定一步生长曲线测定噬菌体的裂解能力,ABTNL-1和ABTNL-2的潜伏期分别为30 min和40 min,裂解量分别为200 PFU/cell和150 PFU/Cell;2株噬菌体对氯仿均不敏感;在0℃至40℃时,两株噬菌体处于相对稳定的状态,可以维持较高的效价,达到50℃后,噬菌体ABTNL-1失去活性,噬菌体ABTNL-2活性降低,当温度达到60℃时,两株噬菌体均失去活性;在中性pH时稳定,在过酸或过碱的条件下失去活性;单一噬菌体在不同感染复数下均能抑制宿主菌增长,但在5 h后细菌数量上升,推测可能产生噬菌体抗性菌株;采用噬菌体鸡尾酒在抑制宿主菌细胞生长方面更有效,且噬菌体抗性菌株出现的时间为10 h。噬菌体全基因组通过蛋白酶K/SDS方法获得,进行高通量二代测序,获得基因组序列,并对其基因进行分析。噬菌体ABTNL-1、ABTNL-2均为双链线性DNA:噬菌体ABTNL-1、ABTNL-2基因组全长分别为112841和49159 bp,GC含量分别为45.54%和51.03%,t RNA数目分别为25和0。基因组功能注释结果显示:噬菌体ABTNL-1、ABTNL-2分别含有144和77个ORFs,具有已知功能的ORFs数目分别是55和36个。经过比对,这2株噬菌体基因组中均不含溶原基因、抗生素耐药基因和毒力基因,证明这2株噬菌体在基因水平上的安全性。通过末端酶大亚基和主要衣壳蛋白基因建立进化树。结果显示,噬菌体ABTNL-1与Demerecviridae亚科,Sugarlandvirus属的噬菌体之间的亲缘关系相对较近;噬菌体ABTNL-2与Drexlerviridae亚科,Webervirus属的噬菌体之间的亲缘关系相对较近。本研究筛选裂解性噬菌体,旨在杀灭多重耐药肺炎克雷伯菌,并研究其特征,并对基因组进行分析,为将噬菌体应用于肺炎克雷伯菌感染奠定基础。
其他文献
甲基苯丙胺(Methamphetamine,MA)成瘾是一个严重的公共健康问题,MA成瘾者会面临认知功能失调和情绪障碍,以及对毒品毫无抵制的渴求。运动干预被认为是治疗毒品成瘾的非药物干预的有效方法。然而,关于运动干预对甲基苯丙胺成瘾者脑功能影响的机制尚不明确。本文借助功能近红外光谱(Functional near-infrared spectroscopy,f NIRS)研究运动干预对30名甲基苯
血液净化是一种通过膜分离或者吸附作用清除患者血液中内源、外源性毒素的临床治疗手段,对于急性中毒、器官衰竭等危重症患者可有效缓解症状,具有良好的治疗效果。近年来重症医学领域研究表明,白细胞介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)作为典型的促炎细胞因子,在“细胞因子风暴”的发生、发展过程中扮演了重要角色,而这种过激的炎症反应是导致癌症免疫治疗、新冠肺炎、细菌感染患者病情恶化的关键因素。因此
据报道,预计到2021年,美国将有189万例癌症新发病例和60万例癌症死亡病例。对于像癌症这样复杂的疾病,单一的治疗策略往往是不够的。多管齐下的联合疗法逐渐进入研究人员的视野。在本论文中,我们讨论了基于仿生金属有机框架(MOF)构建的光热治疗(PTT)、芬顿疗法和化疗的多功能纳米治疗平台所介导的联合疗法治疗癌症的效果。具体研究内容如下:通过构建一种富含三价铁离子的金属有机框架纳米颗粒,其中铁离子作
刺参腐皮综合征因其传染性强、致死率高已成为公认的最为严重的疾病。而实际生产中主要依赖抗生素和化学药物来控制,但长此以往细菌耐药性会愈加严重,同时药物残留、生态环境失衡以及对人体健康的影响等诸多问题引起了国内外学者的广泛关注,开发绿色、安全且高效的抗生素替代品已迫在眉睫。为探究大连地区某刺参养殖场刺参溃烂死亡的病因,本研究从患病刺参病灶处分离出一株优势菌株AP-1,经形态学观察、16S rRNA序列
肠道菌群被认为是人体的新“器官”,在宿主的新陈代谢和疾病的产生发展中发挥着重要作用。肠道菌群体外评价模型具有通量高、能够阐明不同因素影响等特点,具有光明的应用前景。然而当前的体外评价模型未对培养条件进行优化,也未表征其与粪便样品的差异,影响了其准确性。针对以上问题,本论文开展了以下的研究:首先构建了前驱糖尿病鼠肠道菌群的体外培养模型,以体外培养后的菌群与粪便菌群的相似度为评价依据,从YCFA、MP
坚持马克思主义意识形态领域指导地位是党的历史经验总结,更是新时代坚持和完善中国特色社会主义必须遵循的根本原则。坚持和巩固马克思主义在意识形态领域指导地位,必然要求夯实理想信念根基。新时代,面临新形势、新环境,在继承和发扬党在理想信念教育方面的成功经验的基础上,要继续强化马克思主义理论研究阐释,以理论自信坚定理想信念;要牢牢把握党对意识形态工作的领导权,以马克思主义意识形态坚定共产主义理想信念;要进
期刊
长牡蛎是我国北方重要的经济贝类,随着养殖规模扩大,由于缺乏科学完善的苗种培育体系致使长牡蛎出现了品质下降、种质退化问题,这就需要加强选种育苗工作,通过诸如全基因组选择等先进的计算辅助育种技术,选择培育高质量长牡蛎品种。但是随着高通量测序技术的发展,全基因组规模的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)遗传标记密度越来越高,造成基因数据的特征维度远高于样
甜瓜(Cucumis melo L.)是一种重要的园艺和经济作物,在生长发育的各个阶段都易遭受真菌病害如枯萎病、白粉病等的侵扰,严重影响着其生长发育及果实质量,传统上对该类病害的防治主要采用农药喷施的方法,但该方法不仅容易导致病菌产生抗药性,还会对环境造成极大的污染。近年来,利用基因工程技术指导的植物抗病育种和生物农药开发因具有绿色环保、效果显著等优点而越来越受到关注,应用该技术的关键在于抗病基因
由于海洋开发的日益盛行,浮式网箱被广泛应用于养殖业中。但在环境复杂多变的海洋中,浮式网箱会受到不同的载荷影响。对于浮式网箱所受载荷的分析对其进行作用工作时的安全性有着重要作用,直接影响着渔业养殖的收益。为了确定当浮式网箱系泊工作于不同环境条件时其变形及缆绳张力的变化情况,本文以浮式网箱模型为研究对象,利用等效网目法减少浮式网箱模型的单元数目并通过集中质量法简化柔性杆件模型,通过Morison公式及
黄曲霉毒素(Aflatoxin,AFT)是一组具有相似化学结构的有毒的真菌代谢产物。它们能够污染多种农作物,例如玉米,花生及其衍生产品。黄曲霉毒素无论是对人还是对动物都有极强的毒性,因此需要探索相应的措施来去除多种农作物中黄曲霉毒素。与传统物理、化学方法相比,生物法去除的黄曲霉毒素具有去除率高、特异性强、益生性好及环境友好等特点,因此生物法去除黄曲霉毒素近年来成为研究人员的研究热点。为了能够探索到