随着科学技术的飞速发展,经济社会也发生了深刻的变革,高新技术企业作为将知识转化成产品的重要载体,对于促进我国经济的发展具有至关重要的作用。在影响高新技术企业成长的众多因素里,所得税负担作为其成本中比重较高的一项,直接关系到企业日常的生产运营及进一步发展,想要真正意义上为高新技术企业减轻负担,测算其所得税实际税率并探究其中的影响因素意义深远。基于以上背景,本文以2015-2019年692家高新技术企业中的上市公司作为样本,以实际有效税率为指标,测算其所得税税负水平。本文首先分别从企业的经营特征、财务特征以及管理特征的9个指标,构建固定效应模型探究企业的内部因素与其所得税负之间的相关关系;其次又从地区及产权性质两大外部因素进行异质性分析,探究五大地区的高新技术企业及国有性质和民营性质两类高新技术企业之间的税负差别,并分析存在税负差异的原因。研究结果有以下几点:第一,经营特征的指标中资产规模与所得税负呈现显著的负相关关系,研发投入的系数为负,但未通过显著性检验;第二,财务特征指标中的资产负债率、总资产收益率、资本密集度与所得税负为负相关关系并通过了显著性检验;第三,管理特征指标中的股权结构与所得税负有关,股权越为集中,所得税负越低,而董事会结构、监事会规模及内部控制涉及的三个指标未通过显著性检验;第四,从地区和产权性质来看,不同区域及不同产权性质的高新技术企业的所得税负存在差异,就区域来说,所得税负由高到低依次是:东部三大直辖市、东部、西部、中部及东北三省,近年来五个地区间所得税的实际负担水平有缩小的趋势,就产权性质来说,国企与民企的整体税负变化趋势一致且国企的所得税负略高于民企。