花生是重要的油料作物、食用作物和经济作物,在我国,种植面积仅次于油菜,居油料作物第二。花生根结线虫病(Meloidogyne spp)又称花生线虫病,是一种世界性病害,几乎所有种植花生的国家和地区都有发生。在中国,花生根结线虫病从南到北都有发生,其中以山东、辽宁、河北三省发病较为严重。受害花生一般减产20-30%,严重时达到70-80%,甚至绝产。本文采用solexa基因组分析仪对花生抗感根结线虫D99和H22的接种后5天、10天和未接种5天的6个RNA样品(D995C, D995I, D9910I,H225c, H225I, H2210I)进行高通量标签测序,获得了与花生根结线虫抗性相关的花生cDNA文库转录谱,并对花生根结线虫抗性cDNA文库进行了分析,目的是进一步探索花生抗根结线虫的分子机理。本研究主要结果如下：1、文库标签分析。在H225C、D995C、H225I、D995I、H2210I、D9910I六个文库分别获得4728183,4859235,4974812,4704398,4665294,4962367个原始tags,去除杂质tags,获得clean tags分别为4499637,4438410,4770791,4520810,4508944,4731587个,将这些clean tags数量和种类数与clean tag的拷贝数分布变化情况进行统计分析,发现细胞少数基因表达丰度极高,大多数基因表达丰度极低,这符合细胞mRNA非均一性表达的显著特征。2、差异表达基因的筛选检测。H225I和H2210I差异表达基因总数最多为4513个,其中上调表达基因2885个,下调表达基因1628个,其次H225C和H2210I差异表达基因总数4225个,上调表达基因2398个,下调表达基因1827个。差异表达基因总数最少的是D995C和D995I,总数为799个,其中上调表达基因390个,下调表达基因409个。发现随着接种后时间的推移,根结线虫繁殖侵染增加,花生根部受到的胁迫增强,差异表达基因总数也随之增加。这一现象表明花生在受到根结线虫侵染后,某些与抗感根结线虫病有关的基因开启,得到了表达。3、差异表达基因的功能分析。1)D995C和D9910I的差异表达基因GO功能显著性富集为核糖体复合体和结构分子活性,Pathway显著富集的差异路径为核糖体新陈代谢途径。2)H225C和H2210I差异表达基因的GO功能显著性富集为核糖核蛋白复合物,细胞器控基因,细胞内细胞器控基因,核糖体基因,核糖体亚单位基因,结构分子活性,抗氧化剂活性,核成分基因,化学刺激反应,有机物质反应,内生刺激反应,激素刺激反应,胁迫反应。Pathway显著富集的差异路径为核糖体新陈代谢途径,植物病原互作途径,氨基糖和核苷糖新陈代谢途径,精氨酸和脯氨酸新陈代谢途径。3)D9910I和H2210I差异表达基因的GO功能显著富集为细胞器成分基因,核控基因,细胞器控基因,细胞内细胞器控基因,膜附控基因,细胞器膜基因,核糖体基因,核糖体亚单位基因,结构分子活性,化学刺激反应,刺激反应,有机物质反应,多胺代谢过程,乙烯代谢过程,植物生长素刺激细胞反应,多胺生物合成反应,细胞生物胺合成过程,细胞烯烃代谢过程,内生刺激反应,胁迫反应,金属离子反应,无机物质反应。Pathway显著富集的差异路径为核糖体新陈代谢途径。4、花生根结线虫抗性相关基因分析。花生接种根结线虫后,与抗根结线虫品种D99相比,感根结线虫品种H22的编码植物胁迫和防御相关蛋白(PR protein和universal stress proteins, USP)的基因表达丰度偏高,而编码patatin蛋白的基因表达丰度偏低。另外,过氧化氢酶基因在感病品种H22中表达较高。在D99和H22根部,11个基因被鉴定参与细胞分裂素代谢调节,细胞分裂素具有提高植物抗病性,抗寒性和抗旱性功能。4个编码转运载体基因(Unigene69124等)在D99中没有表达,在H22中上调表达,表明这4个基因可能参与巨细胞的形成和构建。