“国立科研机构”是指由国家建立并资助，体现国家意志，有组织、规模化地开展科研活动的各类科研机构，本研究中，还特指由中央政府成立的科研机构。当前，国立科研机构治理已成为我国科技体制改革中所面临的核心问题，在各种相关法律规章中时有提及，然而国内科技界对于此类机构如何治理还很不清晰:一方面，曾经在少数公益类科研机构试点的理事会制度没有能够真正运行，现行的院所长负责制也存在突出的问题亟待解决;另一方面，近两年来政府尽管提出了对公益类事业单位的分类改革，但具体操作仍困难重重。以上问题显示出我国对科研机构的治理情况缺乏深入了解，对谁来参与治理？怎样治理？治理的影响因素？等理论问题还有待深入分析。　　本研究主要参考大学等学术组织治理理论，同时参考利益相关者理论从决策制定角度，对国立科研机构治理的参与主体、治理结构与治理模式、影响因素进行分析，形成国立科研机构治理的理论框架。随后，选取美国、德国、法国与中国等四国共七个典型国立科研机构为案例进行对比分析，观察各类利益主体是如何通过不同治理结构在不同事务决策中扮演不同角色的，进而分析造成这种差别的影响因素。此种研究，不仅从理论上丰富学界对科研机构治理的认识，也对我国建立科研机构治理体系的现实路径具有重要参考价值。　　由此，本研究得出如下主要结论:(1)总体而言，国外已经形成了一套良好的治理体系，引导各类利益相关者参与国立科研机构治理。(2)国外科研机构在治理实践中形成了一些卓有成效的做法，保障了学术权力的良好运转。(3)国内科研机构从整体机制设计到具体实践经验还较为贫乏，在已建立的一些制度安排中，也缺乏有操作性的规则予以落实。