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为了解渤海沉积环境反硝化细菌的群落结构与组成,应用PCR技术为基础的基因文库方法对渤海沉积物反硝化细菌nosZ基因的分子多样性进行了研究。所研究的6个站位共筛选了427个nosZ基因克隆,分别属于320个分类操作单元(perationalTaxonomic Units,OTUs)。各站位OTUs数41～62不等,显示了比较高的多样性。nosZ基因序列与GenBank数据库中最相似序列的相似度在79％～10％。分子系统学分析表明,系统进化树包括胶州湾、大西洋大陆架的沉积物以及以色列荷霍沃特海洋水产养殖水体的nosZ基因序列,将其划分为5个簇(簇Ⅰ至簇Ⅴ)。基于OTUs在各站位的分配和nosZ基因序列系统进化关系,对各站位反硝化细菌群落结构进行UniFrac聚类分析,结果表明B003和B007,B005和B011站位分别两两聚在一起,B001、B015两站位与其它站位关系较远。结合环境因子聚类分析结果,揭示渤海沉积物反硝化细菌群落结构是沉积物间隙水中NH4+-N浓度、溶解氧等多种环境因子共同作用的结果。陆源污染、河流输入以及水动力条件是影响样地反硝化基因多样性的重要因素。