高浓度胰岛素刺激气道上皮细胞的生物信息学研究

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chennyliu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:肥胖相关性肺病发病率随着肥胖人群的增加而增加,研究表明肥胖可能通过多种机制影响肥胖相关性肺病的发生发展和预后,高胰岛素血症和胰岛素抵抗可能在其中起到重要作用。而高浓度胰岛素对气道上皮细胞的具体作用及机制尚不完全清楚。生物信息学能够提取有用的数据,为疾病的发生发展规律提供全面的思路。本研究以高浓度胰岛素刺激的气道上皮细胞为研究对象,基于RNA-Seq技术、iTRAQ技术、RayBiotech蛋白芯片检测结果,用生物信息学方法分析在高浓度胰岛素刺激的气道上皮细胞中起关键作用的分子和通路。方法:本研究对3组高浓度胰岛素刺激的人支气管上皮细胞(BEAS-2B)及其对照组进行RNA-Seq检测。用R软件的DeSeq2包选择RNA-seq的测序结果中的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),以 p值<0.05 和变化倍数(Fold Change,FC)≥1.4(即log2|FC|≥0.5)作为阈值筛选DEGs。对DEGs用多种生物信息学工具进行综合分析。并对3组胰岛素刺激的BEAS-2B和其对照组进行iTRAQ检测,对其进行定量蛋白组学研究。以FC>1.2和Q-value<0.05两个条件作为阈值筛选差异表达蛋白(Differentially expressed genes,DEPs),并用韦恩图取其交集。此外,用RayBiotech抗体芯片技术对高浓度胰岛素刺激后的BEAS-2B细胞上清液进行炎症因子的检测。通过综合分析,确定可能参与高浓度胰岛素对气道上皮细胞影响的关键分子和通路。结果:BEAS-2B胰岛素刺激组与对照组之间共筛选出DEGS146个,其中在胰岛素刺激组上调的DEGs有115个,下调的DEGs有31个。DEGs主要富集的KEGG通路为“金黄色葡萄球菌感染”和“补体和凝血级联”通路。基于iTRAQ的蛋白质谱分析结果表明在胰岛素刺激组与对照组气道上皮细胞之中共发现DEPs99种,胰岛素组-1/对照组-1和胰岛素组-3/对照组-3共同的差异表达蛋白共8种,三组共同DEPs共2种。综合RNA-Seq和iTRAQ结果显示高浓度胰岛素刺激的气道上皮细胞中,补体通路激活,DEGs中C5AR1上调,C5水平增加,但无显著差异;差异蛋白SFMBT1水平增加。此外,细胞上清液的RayBiotech抗体芯片结果显示上皮间质转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关的 TGF-β1 升高。本研究查询了RNA-Seq 及蛋白质谱结果中的上皮间质转化过程中相关因子的表达水平。结果显示,与对照组相比,高浓度胰岛素刺激后,上皮细胞相关的标志物水平降低,间充质细胞相关的标志物水平增加,但差异无显著统计学差异,这进一步提示高浓度胰岛素刺激的气道上皮细胞可能发生上皮间质转化。结论:生物信息学分析显示补体通路、SFMBT1可能参与高浓度胰岛素对气道上皮细胞作用的过程,引发气道上皮细胞上皮间质转化,这为高浓度胰岛素刺激气道上皮细胞的作用及机制提供新的思路。这一结论可能为肥胖相关性肺病的患者寻求新的治疗方向和靶点提供新见解。
其他文献
<正>在已闭幕的全国两会中,分级诊疗作为热点医疗问题再次明确,要加强全科医生培养,改善基层医疗水平,让群众享受优质医疗服务。作为分级诊疗的基础,社区卫生服务在满足人民
人力资源已成长为决定一个企业兴衰成败的关键资源,其价值成为衡量企业整体竞争力的标志。在企业人力资源的管理中融入一种伦理取向是当前提升企业竞争力、促使企业良性发展
英德石,简称英石,是一种具有极高观赏价值和丰富文化内涵的园林名石,在中国赏石文化与传统园林营造中一直长盛不衰,闻名中外。英石主要产自广东省英德市,形貌雄奇突兀,质地坚
伴随着我国广播电视行业不断进步和发展,广播新闻播报风格呈现出多样化的表现形式。广播新闻风格的多样化,有利于听众的审美得到提升,同时也有利于听众提高对于广播新闻的兴
目的:探讨柴朴汤对肝郁型哮喘小鼠模型中MAL,CADM1,IL-33,TSLP的影响。方法:以卵蛋白(OVA)致敏和激发,采用慢性不可预见性刺激干预,建立肝郁型哮喘小鼠模型。将30只6周龄大小的
如今,越来越多的国人开始重视儿童乘员的安全问题。2016年,德国汽车协会(ADAC)与德国联邦道路交通研究所(Bast)把与儿童安全座椅和儿童乘车安全问题相关的信息详细地编撰在《
自从上个世纪七十年代在美国出现后,资产证券化作为现代金融市场上的新起之秀,一度经历了爆发式的快速增长,并与市场已有的股权筹资、债权筹资一并成为现有的重要筹资途径,并
数据是税收风险管理的核心和基础,本文基于数据在税收风险管理中的重要意义,剖析了税收风险管理中数据存在的问题,并从构建法治基础、管理平台、体制机制以及人才保障体系四
概括了英德石牯塘长岗岭多金属矿区的地层、构造、岩浆岩等成矿地质条件,分析了矿区的成矿控制因素、矿床成因及找矿标志,进而对矿区的找矿前景进行了初步探讨。
目的:偏头痛的预防性治疗目前仍以药物治疗为主,但非药物性治疗尤其是我国传统医学中的针刺治疗逐渐受到越来越多的关注。普萘洛尔作为一线用药,并无与较,探究针刺治疗与普萘