红条鞭腕虾(Lysmata vittata)属于一种小型海洋观赏动物,在水族市场上颇受欢迎。该物种具有特殊的性别模式即雄性先熟的真雌雄同体(protandric simultaneous hermaphrodite,PSH),有关其繁殖生物学的报道迄今尚少。本研究以实验室繁殖的个体为实验对象,通过形态学和组织学的方法对红条鞭腕虾从仔虾初期开始到性成熟阶段个体的性腺发育及外部性征进行观察。发现所有个体的性腺均由前端的卵巢和后端的精巢组成。根据性腺形态学和组织学特征可将红条鞭腕虾性腺发育划分为4个时期。性腺Ⅰ至Ⅲ期,精巢逐渐成熟但卵巢尚未成熟,定义为雄性阶段,该阶段第一腹肢内肢末端上具有5-8个钩状结构cincinnuli,第二腹肢内肢的内缘具有一细棒状带刺的突起,为雄性附肢;性腺发育进入IV期,精巢和卵巢均处于成熟阶段,定义为真雌雄同体阶段。在真雌雄同体阶段,绝大部分个体第一腹肢内肢上的cincinnuli以及第二腹肢上的雄性附肢已缺失,第二腹肢内肢上着生很多棘刺。本研究首次系统地观察了鞭腕虾属物种性腺发育的全过程以及其外部性征。红条鞭腕虾性腺为精卵巢,具有PSH这一特殊的性别模式,其性别分化和性腺发育的分子机制尚不清楚。本研究采用高通量测序技术获得其两个发育阶段的转录组基本信息。经过测序,获得了大量原始数据,并通过拼接组装得到共59798条Unigenes,平均长度为799.23bp。本研究通过使用BlastX与NR、String、Swissprot、KEGG数据库五个数据库进行对比,得到的相应的注释信息显示,其中有15534个(25.98%)独立基因在NR中得到注释,有3410(5.70%)个独立基因在String中得到注释,10899个(18.23%)独立基因在Swissprot中得到注释,8554(18.23%)个独立基因在KEGG中得到注释。对两个发育阶段样本的文库进行对比,得到4592差异表达基因,并发现了IAG、CFSH、GIH等一系列可能参与性别分化和性腺发育的重要差异表达基因以及Wnt、ovarainsteroidogenesis等相关通路,为将来深入开展其分子机制研究提供了重要信息。