在2018年国税地税征管体制改革中,全国省级和省级以下国地税机构合并,同时撤销全国各县(市、区)税务局稽查局,设立729个跨区域稽查局,标志着跨区域稽查工作在全国税务系统的全面铺开。跨区域稽查的诞生,是税务系统破解执法刚性弱化、排除地方行政干扰的必要举措,是打击涉税违法行为、震慑涉税违法活动的有力手段,是维护市场经济秩序、阻止国家税款流失的重要法宝。但是跨区域稽查工作开展一年多来,在实践中也发现了职责划分不明、法制建设乏力、稽查手段落后、内外协调不畅、人才力量薄弱、绩效考核错位等等问题,制约了跨区域稽查的工作效率,影响了税务稽查优良形象。本文在界定税务稽查和跨区域稽查的核心概念后,以依法治税、纳税遵从、行政效率等理论为基础,阐述跨区域稽查工作的出台背景和探索历程,再以Y市税务系统跨区域稽查工作为样本,运用调查研究、比较分析、参与观察、实地走访等方法,从当前现状、存在问题和原因分析三个方面概述了Y市税务系统跨区域稽查的详细情况,借鉴国内重庆、广西地区和国外美国、日本的跨区域稽查工作经验,有针对性的提出了提升Y市税务系统跨区域稽查工作水平的五条对策。本研究着眼时代当下,紧贴改革需求,坚持严谨、细致的研究过程,力求发现问题透彻、原因分析深刻、对策建议实用,为国内各地区税务部门开展跨区域稽查工作提供一份选择方案。