出生缺陷可由遗传因素(染色体畸变、基因突变等)或环境因素单独或交互作用引起,不仅影响婴幼儿的身体健康,而且会造成人力资源的耗费,甚而影响经济社会发展的可持续性。常规的检测如染色体核型分析检测周期较长,并且不能应用于自动化,受其分辨率限制无法检测到一些微缺失或微重复的变化。因此在一些情况下,如核型分析结果正常但超声显示异常的孕妇,需要进行进一步的检测,以查明原因。很多情况下,已经错过了重大出生缺陷终止妊娠的最佳时间。微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization,aCGH)是一项可在全基因组范围内检测基因组DNA片段拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的高分辨率技术,正逐渐替代细胞遗传学方法成为一项必要的例行临床诊断技术。aCGH技术在检测发育迟缓、智力低下、自闭症、多基因异常和先天性畸形患者的CNVs方面优势明显,也因此将成为发现致病基因和产前诊断的重要工具。aCGH还为癌症研究和不同种类恶性肿瘤的诊断、分型和预后评估提供有用数据。aCGH兼具高通量、高分辨率的特征,可一次性检测大量的拷贝数变异。在过去数年aCGH的发展及其临床应用彻底改变了患者的诊断检查方式,并大大促进了许多基因疾病的分子基础的鉴定。实验室现有一整套基因芯片制作、验证相关的仪器设备,并拥有独特的探针资源,我们设计引物将1700万条覆盖整个基因组(去除重复序列)的寡核苷酸序列分为23033组。收集并整理出生缺陷的相关信息,从中选取部分探针制作针对出生缺陷的靶向阵列芯片,理论上可检测所有已知的出生缺陷。经初步验证试验证明了该芯片对于检测出生缺陷的可行性。与市面上的一些检测芯片相比,芯片灵敏度更高,覆盖率更高,使用更方便,因此检测结果更加精确,再加上有自主知识产权,可自制芯片,在成本上有很大优势,适合中国目前的国情。我国是人口大国,也是出生缺陷的高发国家,中国政府历来高度重视出生缺陷的防治工作,本课题符合中国国情并且有着广泛的应用需求。核酸芯片作为一种强有力的分析工具,在出生缺陷的临床诊断方面得到广泛应用。同时已与多家医院建立起合作关系,用于临床诊断出生缺陷。