中央银行支付清算系统是支付清算体系的中枢,也是确保经济、金融正常运行的最重要基础设施之一。随着我国市场经济的发展,由中国人民银行主导的第一代支付清算系统已经不能满足现代经济和金融快速发展的需要,迫切需要建立操作简便,运行安全、管理集中、统一支付的大支付清算平台——第二代支付清算系统。新的支付清算系统的建成必将对我国商业银行的经营活动带来深远的影响。做好系统投产后的管理工作,更大程度上发挥新系统的积极效应,防范潜在风险的发生是人民银行及各商业银行等金融机构参与者的重要任务。本文主要从以下几个方面进行了分析：第一,中国人民银行第二代支付清算系统介绍,包括中国人民银行第二代支付清算系统概述、建设历程及与第一代支付清算系统的比较分析；第二,着重分析了第二代支付清算系统的建设对我国商业银行经营活动产生的影响；最后,针对第二代支付清算系统上线后,存在的潜在风险及给商业银行流程改造、业务拓展带来的机遇,分析金融机构应该做好投产后管理以应对潜在的风险,做好业务推广,增强市场竞争力。第二代支付清算系统是中国人民银行主导的,各商业银行及其他金融机构参与的高效、安全运营的现代化支付清算系统,对其进行深入、全面的分析,并对各家参与机构带来的变革进行研究,对商业银行的经营管理尤其重要,做好系统开发投产,后期管理,防范风险,把握机遇拓展业务,有准备的面对新的支付清算系统是今后一段时期内参与机构必须研究的重要课题之一。