清洁发展机制（CDM）是《京都议定书》中引入的灵活履约机制之一，近年来在我国取得迅猛发展。综合区域经济和低碳经济的相关理论，以清洁发展机制的水电项目为切入点，概括分析水电项目在全球以及我国的发展现状，从经济、社会、生态三个方面探讨CDM水电项目对区域发展的影响，并构建线性回归分析模型，量化研究CDM水电项目投资额、发电量与区域生产总值、第一、二、三产业的产值、固定资产投资规模之间的关系，讨论CDM水电项目单位投资额与发电量对区域经济产生的影响。在线性回归分析的基础之上，按照科学的指标选取原则选取评价指标，构建评价指标体系，并根据计量经济学知识建立区域协调发展度评价模型，用来评测CDM水电项目与所在地区域发展之间的协调程度。选取开发水电项目数量最多的云南地区做实证分析，搜集云南地区区域经济发展的各方面统计指标，结合CDM水电项目的各方面信息，综合探讨当前CDM水电项目开发过程中的问题，进行区域协调发展度测算，得出了CDM水电项目经过几年的发展已经融入云南区域发展的大趋势中，与区域发展基本协调，并呈现出受项目审批周期的影响而特有的规律的结论。依据所得出的CDM水电项目对区域经济发展有积极的贡献，并且与区域经济同步协调发展的结论，认为开发CDM项目是我国发展经济、维护环境、促进节能减排、推进低碳事业、实现可持续发展的有效途径，因此建议积极参与项目开发。在研究过程中也发现了我国CDM水电开发过程中存在的问题和阻碍因素，最后就所提及的制约CDM项目开发的各方面问题给出了相应的建议，从政府、社会、企业等层面给出了可操作的意见，提出了消除不必要的技术壁垒、简化项目审批程序、鼓励多角度研究、规范项目咨询市场、培养专业人才等可行方案。最后根据研究所得结论，分析CDM项目的未来发展前景，预测CDM在未来所面临的机遇与挑战，提出应对措施。