[目的]对西藏古北界地区蚋类进行区系调查，初步摸清该地区蚋相本底资料。并测定后克蚋属、畦克蚋属、特蚋亚属、山蚋亚属、纺蚋亚属、维蚋亚属及蚋亚属共2属、5个亚属代表种的COI基因及rDNA-ITS序列，进行系统发育研究。　　[方法]选择西藏古北界代表性地区，按常规方法采集幼蚋，经隔离培养育出两性成虫，制片、形态鉴定；据此对西藏古北界地区蚋类名表进行调查，同时选取2属5个亚属代表种标本，提取基因组DNA，用PCR扩增出COI基因及rDNA-ITS序列，克隆PCR产物并测序。用Primer Priemer5.0，ClustalX1.83和MEGA4.0等相关软件分析所有序列，构建系统发育树。　　[结果]记载西藏古北界地区蚋科3属（畦克蚋属、后克蚋属和蚋属）19种，其中含9个新蚋种及1个中国新记录种，并获得后克蚋属、畦克蚋属、特蚋亚属、山蚋亚属、纺蚋亚属、维蚋亚属及蚋亚属共2属、5个亚属代表种55条COI基因的全长序列，长度为1557-1600bp，GC含量为31.1-36.0％。及53条 rDNA-ITS序列的全序列，长度为341-660bp，GC含量为24.0-31.1%。其中ITS1的长度为106-345bp，GC含量为16.1-32.2%；ITS2的长度为258-480bp，GC含量为22.3-30.1%。分别构建了基于COI基因及ITS1-ITS2联合序列的蚋科系统发育树(2属5亚属)。　　[结论]西藏古北界地区蚋类具明显的古北界区系特征，分子分类建议将后克蚋属降为蚋属的亚属处理。