本研究根据内蒙古三河牛的生产和育种现状,采用生物经济模型估计育种目标性状的边际效益；以选择指数法和基因流动法为基本方法,应用育种规划程序ZPLAN分析三河牛现行育种方案的育种效果,对影响育种效率的各个因素进行优化分析,最终确定优化后较为理想的育种方案；最后,比较了后裔测定育种方案、青年公牛育种方案和基因组选择育种方案的育种成效和经济价值,主要得出以下结果：1.构建三河牛的生物经济模型,计算三河牛目标性状的边际效益。以乳成分(乳脂率、乳蛋白率、体细胞)定价时,各目标性状的边际效益为：产奶量(kg)2.26元、乳脂率(%)40.48元、乳蛋白率(%)61.39元、体细胞数-231.52元、初生重(kg)6.19元、育肥期日增重(g/天)1.39元、屠宰率(%)76.70元、首次产犊日龄(天)-1.62元、产犊间隔(天)-2.71元、使用寿命(天)0.25元。对影响边际效益的因素进行了敏感性分析,牛奶、牛肉价格与目标性状边际效益成正相关,饲料价格与其成负相关。2.育种目标性状即乳用性状、肉用性状、功能性状的相对经济权重比例为62：15：23,近似于3：1：1。3.设定规划期为20年,实施现行育种方案育种效益为620.33元/母牛/年,预期可获得综合遗传进展为151.28元/母牛/年。现行育种方案的优化分析结果表明,在当前群体基础母牛规模为50000头的条件下,主动育种群比例30%,后测试配母牛比例60%,每年选留测验公牛数15头,种子公牛、种子母牛的使用年限2年,测验公牛、验证公牛的使用年限1年,一般种用母牛的使用年限3年时,育种方案最为理想。4.对后裔测定、青年公牛、基因组选择三种育种方案进行比较分析,结果表明：后裔测定育种方案的育种效益最低,育种投入高,世代间隔长,但每年可获得的遗传进展相对于青年公牛育种方案较高。基因组选择育种方案在世代间隔、遗传进展、育种效益方面的优势均优于后裔测定和青年公牛育种方案。就当前的内蒙古海拉尔地区三河牛的生产、育种条件和长期的育种策略而言,基因组选择育种方案在育种实践上具有一定难度,后裔测定仍然是目前首先需要考虑的育种方案。