星星草(Puccinellia tenuiflora)应答Na2CO3胁迫的多组学整合分析

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sdgvf43g43g3
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
土壤盐碱化是限制植物生长和农作物产量的主要环境因子。盐碱逆境会造成植物受到离子胁迫、渗透胁迫与氧化胁迫。此前,人们更多地开展了离子胁迫与渗透胁迫的研究,然而,植物盐碱逆境引起的氧化胁迫的分子调控机制还不清楚。星星草(Puccinellia tenuiflora)是我国北方盐碱地广泛分布的耐盐碱牧草,是研究盐生单子叶植物盐碱应答机理的良好模式植物。研究星星草盐碱逆境引起的氧化胁迫的分子调控机制具有重要意义。本研究利用刚刚建立的星星草全基因组数据库,开展了碱性盐应答转录组、蛋白质组和氧化还原蛋白质组学研究,在全基因组水平分析了星星草Na2CO3应答的分子调控网络,系统揭示了叶片与根部碱性盐应答的转录、翻译与翻译后调控分子机制,并利用分子遗传学手段初步解析了碱性盐应答的信号转导机制。转录组学研究结果表明,星星草叶片与根部分别有13,290和15,859个基因参与Na2CO3胁迫(0.5 h、6 h和7 d)应答。这些基因表达模式表明,叶片中参与光合作用、转录调控、蛋白质合成与降解和基础代谢等,根中参与胁迫防御、信号转导、膜与运输等途径在盐碱应答过程中具有重要作用。其中,研究发现,30多个基因可能是根部糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白(LLG)与类受体激酶(RLK)FERONIA(FER)信号通路中的重要成员。定量蛋白质组学与氧化还原蛋白质组学研究结果表明,在应答Na2CO3胁迫(0.5 h和6h)过程中,星星草叶片的189种蛋白质丰度改变,62条肽段氧化还原水平改变;根部347种蛋白质丰度改变,168条肽段氧化还原水平变化。这些蛋白质的丰度与氧化还原水平变化模式表明,激酶信号通路、膜运输、细胞骨架重塑、ROS稳态、胁迫与防御、基因表达和蛋白质周转、糖代谢,以及氨基酸代谢等途径在盐碱应答过程中发挥了重要作用。通过整合转录组学、蛋白质组学与分子遗传学的研究结果,推测星星草利用多种策略应答Na2CO3胁迫,主要包括:(1)叶片参与光合电子传递、ATP生成和碳同化过程的蛋白质丰度和氧化还原水平改变,从而调节光合作用;(2)通过蛋白质氧化还原水平变化调控膜泡运输、蛋白质转运、脂质运输,以及小分子物质(水分、离子和代谢产物)转运等过程;(3)动态调节ROS清除酶系统中多种酶的蛋白质丰度和氧化还原水平调控其酶活性,维持ROS稳态:(4)根中LLG-FER-FLS2信号通路调控盐碱应答基因表达。定位于细胞质膜的PutLLG1,作为FER的共受体,在根中优势表达,并受到Na2CO3的诱导。PutLLG1保守基序中Cys130氧化水平在Na2CO3胁迫时显著上升,这暗示着Cys130的氧化还原变化对PutLLG1的蛋白质功能可能有影响。PutLLG1内有8个保守的Cys 残基形成 4 对二硫键(Cys50-Cys98、Cys66-Cys76、Cys77-Cys121 和 Cys85-Cys130)。酵母双杂实验结果表明,不同Cys位点突变对PutLLGl与PutFER互作的强度影响不同。PutFER与PutLLGC85/130A互作强度明显弱于其它各组合,推测Cys85-Cys130可能调节PutLLG1构象影响其与PutFER互作,进而调节下游信号通路。本研究的结果为深入认识盐生牧草盐碱胁迫应答分子调控网络提供了新的线索,为开发利用盐碱地植物资源,进而利用分子设计育种技术创制农作物新品种奠定了基础。
其他文献
油水两相流广泛存在于现代工业生产之中,其流型对其流动及传热特性有很大的影响,因此如何确定两相流的流型一直是两相流研究中的一个重要课题。传统的油水两相流流型识别方法主要有两种:一种是采用人为观察或测量的方法;另一种是利用流型转变准则或流型图的方法。传统的流型识别方法不但受到主观因素的影响,而且不能实现流型的在线识别,因此需要改进传统的识别方法。本文在油水两相流实验台上进行了实验研究,并对获得的垂直上
气固流化床是化工、电力、石油等生产过程中的重要装置,获取流化床的流型和流型转换的信息对提高流化床的性能和传热、传质效率至关重要,不同的流型,传热性能和流动机理是不相同的。因此,准确的识别流型是气固两相流参数检测的一项重要内容。但同时由于气固流化床内气泡运动行为是一个非常复杂且动态非线性,对研究流化床压力脉动信号的特征和流型识别带来了很大的困难。本文在大量数据的基础上,将二代小波、混沌理论、多重分形
在新冠肺炎疫情的持续冲击下,全球化及其治理体系面临重大转型。虽然从历史的长时段来看,全球化是不可逆转的,但是,疫情带来的国家和市场主体选择行为的变化,将加速昔日美国主导的新自由主义超级全球化的终结,以多元化、慢速化、区域化和数字化为特征的再全球化将开始登上舞台。同时,未来的全球治理在大国博弈下会发生权力、观念和制度的结构性重塑,呈现权力的多元化、观念的多样化以及制度的碎片化趋势。中国需要加快构建新
森林可燃物含水率表示可燃物内部水分多少,其动态变化主要受气象要素和自身理化性质的影响,其值大小对森林火险预报至关重要。直接烘干法得到含水率值最准确,但在实际应用中,我们需要得到准确实时的可燃物含水率值,而基于烘干法往往都是前一段时间的含水率,无法在实际中应用。因此,研究高精度的可燃物含水率预测模型,是世界各国林火研究者关注的重点。加拿大火险等级系统中的3个湿度码能够反映可燃物的干燥程度,而且由于其
树林的次生木质部的发育形成的需一个独特的、复杂的调控体系来完成。木材的重要生态价值和经济价值,使人们对其发育形成的调控机制展开了广泛的研究。转录调控和蛋白质组调控是木质部发育形成的重要调控方式之一,虽然木材形成TRN的一些节点转录因子基因被鉴定分析,尤其是次生细胞壁生物合成建立了相对的4层调控网络,但对于整体的次生细胞壁生物合成调控体系来说还是很局限的,目前次生细胞壁生物合成调控网络还处于分析鉴定
Stem taper equations are essential tools for assessing the stem profile and volume in forest management studies.Such equations have long been investigated for different birch species in Canada,USA,Eur
学位
在全球气候变化的大背景下,土壤盐碱化已成为全球广泛关注的最严重环境问题之一。土壤盐碱化会改变土壤理化性质,影响植物种子萌发,生长和繁殖,从而导致植物生物量下降。全球作物每年因土壤盐碱化减产超过20%。盐碱地在我国分布广泛,有接近7%的农业耕地受到盐碱化影响,迫切需求对盐碱地的生态修复技术。沙枣(Elaeagnus angustifoliaL.)为胡颓子科多年生落叶乔木或小乔木,因为其生活力强,具有
大草蛉(Chrysopapallens)作为重要的捕食性天敌昆虫,在农林害虫生物防治中具有非常广阔的应用前景。营养丰富且价廉的饲料与高效的饲养体系是实现大草蛉商业化生产的前提。目前大草蛉饲养过程中,当饲料营养不平衡时,或通过冷藏延长产品货架期时,常会碰到产卵量减少,卵孵化率下降等问题,严重制约生产与应用。研究大草蛉生殖遗传特性,有利于发展调控大草蛉产卵的技术与方法,提高饲养效率,促进商业化生产。胰
森林生态系统土壤有机碳库在全球的碳循环与碳平衡中扮演重要角色。森林火灾作为非连续的干扰因子,是生物地球化学循环的驱动因子,显著改变生态系统的结构和功能及养分循环与能量传递,引起森林碳库与碳分配格局的变化,进而影响森林演替进程及固碳能力。森林火灾通过直接改变植被覆盖度进而影响植被碳库和营养元素周转,最终影响植被的碳固定及碳从植被向土壤的转移,导致不同碳库之间的重新分配。研究森林火灾对森林生态系统土壤
作为一种天然且可再生的生物质材料,木材成分交错复杂的排布构成了木质材料多尺度的各向异性取向的孔道结构,同时木材的功能性官能团为其提供反应活性,使其成为了一个理想的生物基模板,赋予了木材仿生可行性、便捷性及功能性,为木质材料与功能性材料的结合奠定了优良的基础。智能响应材料是在外界的刺激下,做出相应响应一种材料,其中,光温智能响应,不依赖于其它化学助剂,响应速度快而且剧烈。同时,光和温度的变化不仅在自