牛种布鲁氏菌2308 sRNA的鉴定及分析

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gloriayl2005
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布鲁氏菌侵入宿主细胞后会面临着恶劣的生存环境。为适应这种环境,布鲁氏菌需要在转录水平和转录后水平调控特定相关基因的表达。目前的研究主要集中在布鲁氏菌的转录调控,而其转录后调控,尤其是sRNA参与的转录后调控尚不明确。本研究首先在全基因组水平上利用生物信息学方法对牛种布鲁氏菌2308的sRNA编码序列进行了分析和预测,获得129个假定的sRNA编码区域,经RT-PCR方法验证共获得50个sRNA。对假定这些sRNA的靶点预测结果表明,布鲁氏菌sRNA主要影响细胞膜合成、氨基酸代谢、翻译后修饰、信号转导机制、铁的转运和代谢、转录调控等基因的表达。为了研究sRNA的表达特性,对其中22个sRNA在不同生长阶段和不同应激环境下的表达水平进行检测,结果表明,21个sRNA在不同生长阶段表达水平有显著变化,所有sRNA的表达水平在不同应激环境中出现差异。为了研究布鲁氏菌的sRNA如何被调控,分别构建了vjbR、RpoE1、RpoE2和物缺失株,并检测了上述缺失株中sRNA的表达水平,结果表明,vjbR、RpoE1、RpoE2和hfq分别影响16、20、10和7个sRNA的正常表达。通过对sRNA的靶点预测和验证,我们鉴定出一个sRNA可以抑制与布鲁氏菌铁代谢相关的hem H基因的表达,故将这个sRNA命名为BsrH(Brucella sRNA regulating HemH)。检测不同应激环境中BsrH的表达水平,结果表明在酸性环境、过氧化氢氧化应激及最低营养培养基中BsrH表达水平上调,而在缺铁培养基中表达水平则明显下调。尽管在BsrH过表达菌株中布鲁氏菌毒力未受到显著影响,但与野生株相比,体外缺铁培养基中增殖显著下降表明BsrH与布鲁氏菌的铁代谢密切相关。为了确认布鲁氏菌毒力相关的sRNA,本研究还分别构建了 50个sRNA的过表达菌株,并通过J774A.1巨噬细胞感染模型测定其毒力,结果表明过表达BASRCI74影响布鲁氏菌在胞内的毒力。为了探究其引起牛种布鲁氏菌毒力下降的机制,我们检测了 BASRC 174过表达菌株在应激环境中的生存能力,结果表明BASRCI74过表达菌株在缺铁培养基及最低营养培养基中增殖能力显著下降。通过双质粒报告系统对BASRC I 74靶点的进一步研究发现,布鲁氏菌基因组中胞嘧啶-N4-特异DNA-甲基转移酶基因BAB1——1154的表达水平受到BASRC I 74的调控,提示BASRC I 74可能是通过调控环境应激相关基因或影响限制-修饰系统而对牛种布鲁氏菌的毒力发挥调控作用。木研究为揭示sRNA相关的转录后调控及布鲁氏菌致病机理的解读提供了重要的依据。
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