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胡萝卜软腐果胶杆菌是一种强致病性革兰氏阴性植物致病菌,通过分泌果胶酶、纤维素酶、蛋白酶等酶系降解植物的维管束细胞,导致植物罹患软腐病。胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种PC1菌株(Pectobacterium carotovorum PC1, Pct)的宿主范围分布广泛,造成了该菌种难以根治的局面,每年都带来巨大的农业经济损失。由于缺少专一性的杀菌剂,目前针对植物软腐病仍主要采用预防为主的手段。全基因组代谢网络集合了多种类型的数据,可以将基因型和表型结合起来,从组学的角度探究胡萝卜软腐果胶杆菌的代谢形式,