lncRNA FENDRR在宣威肺癌细胞中的表达及生物学功能研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:gy19910192
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目的1.研究lncRNAFENDRR在宣威和非小细胞肺癌细胞中的表达情况;探讨FENDRR基因表达变化对云南宣威肺腺癌细胞株XWLC-05细胞增殖、迁移及侵袭的影响。2.基于全基因组宣威肺癌组织芯片测序的生物信息学分析,探讨lncRNA基因在肺癌恶化过程中引起的功能效应,为进一步研究lncRNA FENDRR对靶基因调控影响宣威肺癌的发生发展机制奠定基础。方法1.提取宣威肺癌XWLC-05与非小细肺癌A549细胞中的lncRNA,用qRT-PCR分析FENDRR的表达情况;2.构建人全基因合成真核过表达重组质粒pEX-3-FENDRR,在宣威XWLC-05细胞株中过表达FENDRR基因;构建shRNA慢病毒载体LV3-FENDRR,病毒纯化并包装质粒,合成即用型病毒,测序并鉴定病毒滴度。穿梭质粒合成病毒液侵染XWLC-05细胞:PCR验证转染效率。3.综合运用MTS法检测细胞增殖,Transwell小室结合Matrigel胶法进行迁移侵袭相关的体外功能研究。4.对FENDRR在宣威肺癌中潜在生物学功能进行分析,并通过UCSC生物数据库预测靶基因;通过Starbase v2.0网站软件对micRNAs依赖的lncRNA功能进行预测,分析FENDRR在Go Terms中的调节作用从而综合评价靶基因的可靠性。结果1.实时荧光定量PCR检测:宣威XWLC-05细胞比较NSCLCA549细胞FENDRR的表达量 13.60E-04±0.01vs0.74E-04±0.01,P<0.05。2.PCR验证转染后FENDRRmRNA表达显示:XWLC-05经转染过表达质粒后处理组与对照组之间表达差异明显(P<0.05);慢病毒干扰LV3-FENDRR结果显示:经转染慢病毒干扰组与对照组表达差异无统计学意义(P>0.05)。3.过表达pEX-3-FENDRR结果表明:MTS活细胞数与吸光度值呈正比,XWLC-05细胞在490mm波长下的吸光度值逐渐降低,说明活细胞数减少,细胞生长受抑制(P<0.05);pEX-3-FENDRR转染后XWLC-05细胞迁移、突破基底三维结构膜的侵袭能力明显下降,过表达lncRNAFENDRR可抑制细胞迁移和侵袭潜能(P<0.05)。4.经检索,获得与反向转录的FENDRRmRNA启动子区域的大片段序列重合的基因有202个,其中正义链序列基因与启动子序列重合程度达90%以上靶基因筛选出 7个,分别是BTD、PDGFD、RP11-359G22.4、GNG4/mir5096、SYCP1、AGBL3、ANKRD6/LYRM2。转录因子预测分析发现,FENDRR可能与UPF1干性分化因子有关。另外,ceRNA相关生物学功能分析显示,GO:0010467 gene expression 内 FENDRR 基因明显富集,与 CCTN2、LSM11、MAPKAPK2、POU2F1等miRNAs可能存在相互作用。结论LncRNAFENDRR在宣威肺癌中具有明显抑癌活性,可通过调节基因表达从而抑制细胞增殖、迁移与转移等肿瘤侵袭力发挥功能。可能参与UPF1、FOXF1、CCTN2等靶向基因潜在调节肺癌的生物学作用。
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