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本文采用聚合酶链式反应(PCR)技术对栉孔扇贝(Chlamys farreri)大连、青岛、长岛、朝鲜及日本5个自然群体89个个体的核糖体转录间隔子序列(ITS-1)进行了扩增。PCR产物纯化后经T载体连接进行了克隆、测序，排序后得到长度为306bp(不含引物)的序列，A，T，G，C含量分别为33.1％、21.3％、20.6％、25.0％，AT含量高于GC含量。MEGA软件检测到44个变异位点，其中有8个插入／缺失突变的的核苷酸位点，36个转换或颠换核苷酸位点，其中3个位点(60、213、215)转换与颠换同时存在，共51种单倍型。5个群体中朝鲜群体拥有的单倍型最丰富，为18个，而且拥有最多的多态性核苷酸位点，长岛群体、日本群体和青岛群体的单倍型数分别为16个、13个和13个，大连群体的单倍型最少，为9个。各群体遗传距离在0.006～0.009之间。在多态位点数S、平均核苷酸差异数K和核苷酸多样性指数Pi三个指标上，朝鲜群体的值相对较高，长岛群体次之，其次为日本群体、青岛群体，大连群体最低。用AMOVA软件计算出群体间差异为2.69％，群体内部差异为97.31％，表明主要的遗传变异来自于群体内部。利用ITS-1序列构建的UPGMA分子系统树显示各群体没有明显的聚类。结果表明5个群体中以朝鲜群体的遗传多样性最高，其次为长岛群体、日本群体、青岛群体，大连群体最低；不同自然分布区的栉孔扇贝未出现明显的遗传分化。 本研究对取自山东青岛地区的海湾扇贝(Argopecten irradians)养殖群体的核糖体基因转录间隔子ITS-1序列进行了PCR扩增，得到了300bp左右的清晰带，扩增产物转入T载体后进行了克隆、测序。海湾扇贝ITS-1序列排序后长度为323bp(不含引物)，A，T，G，C含量分别为34.1％、22.8％、21.2％、21.9％，AT含量高于GC含量。在海湾扇贝26条ITS-1序列中共检测到12个变异位点，其中存在3个插入／缺失突变的的核苷酸位点，8个转换位点1个颠换核苷酸位点，共11种单倍型，通过DNAsp软件，对海湾扇贝群体的遗传多样性参数进行计算，得到平均核苷酸差异数(K)为0.763、核苷酸多样性指数(Pi)为0.00238，单倍型多样性指数(Hd)为0.578。显然，海湾扇贝养殖群体的遗传多样性明显栉孔扇贝和海湾扇贝的群体遗传多样性研究及扇贝科几种贝类的分子系统学研究较低。 核糖体转录间隔子(rrs一l)片段序列是系统演化研究中非常有用的核基因序列之一。本实验对栉孔扇贝(Chla峨vsfarreri)、华贵栉孔扇贝(Chlan衫)s nobilis)、海湾扇贝(A厂g口pee ten irradians)、虾夷扇贝(Parinopecten夕essoensis)4种扇贝的ITS一1序列进行了扩增，扩增产物转入T载体后进行了克隆、测序。各物种rrs一1序列长度在337bP-360bp(包括引物)之间，四种扇贝间rrs一1序列长度差异不大，通过序列比对，四种扇贝间ITS一基因序列同源性值在38%一75%之间。在序列的中间部分具有2个保守区域，其同源性高于92%。 利用得到的4种扇贝的rrs一1序列和文献发表的4种扇贝的rrs一1序列进行了比较，采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建分子系统树。系统分析显示，采用NJ和MP方法构建的系统树表现出完全相同的拓扑结构。聚类分析显示，海湾扇贝与AqueiPecten opercularis聚在一起，结果支持了wal ler(1991，1993)将Argopecten划分到AequiPecten类群中的分类方法。rrs一1序列分析的结果显示华贵栉孔扇贝的分类地位与传统的分类有所差异;海湾扇贝与扇贝亚科的关系比与栉孔扇贝亚科的关系更近;虾夷扇贝与栉孔扇贝的关系较为相近。