中国是荔枝的发源地，种质资源非常丰富，仅海南就有4，000hm~2荔枝实生树，此外，在坝王岭、五指山、尖峰岭、吊罗山和乐东金鼓岭上还有成片的野生荔枝，一起构成了一个巨大的海南荔枝种质资源库，既是我们目前进行实生选种的基础，又是将来杂交育种的源泉。 在培育荔枝新品种的过程中，最常用的是实生选种和芽变选种。而荔枝杂交育种一直都没有采用，因为对现有荔枝种质的遗传背景不清楚。而要想从更深层次上发掘和利用那些珍贵的宝藏，就必须找到一个强有力的进行荔枝种质分析的工具。 鉴于此，本研究采用近年来发展起来的分子标记技术开展了荔枝SSR标记的研究工作，以便为荔枝群体遗传结构的研究提供一个强有力的、高效的检测手段。并利用自行开发的荔枝特异性SSR标记对37个荔枝种质和2个龙眼品种进行了遗传多样性分析。 主要结果如下： (1) 首次成功地开发了22个荔枝SSR标记。应用SAM法分离、克隆了100个荔枝SSR序列，加上搜索数据库所获得的一个SSR序列，一共101个序列用于特异引物的设计。仅从71个序列的82个位点设计出特异引物。合成52条特异引物与5′-锚定简并引物配成52对，对其中的41个位点进行检测。其中19对引物扩增出相应大小的片段，另外15对SSR引物扩增出了非预期片段。最后，从34对出带的引物中，筛选出多态性引物28对，获得22个荔枝位点特异性SSR标记。从测序算起，产生多态性SSR标记的效率为44％。 (2) 用34对荔枝的SSR引物对两个龙眼属植物品种石硖、储良进行转移性扩增，其中22对引物在26个SSR位点有强带扩增，转移扩增率为64.7％。说明荔枝绝大多数SSR引物对龙眼属植物具有适用性。 (3) 用开发出来的荔枝SSR引物对37个荔枝栽培品种和2个龙眼品种进行遗传多样性分析，获得遗传相似性矩阵，其范围在0～1之间，平均0.556。其 中，三月红与海垦互4号、海垦1且号间的遗传相似性最小：白糖罂与海垦 8 号之间的遗传相似性最大，相似系数为0．952；并鉴定出错蛛红与海垦 13号是同一个品种。（4）采用UPGMA ＄对39个种质进行聚类分析，供试品种在相似系数为0．556 处被划分为5个类群。（5）无核荔枝A。号与A；。号之间的遗传相似性系数为0．762，大于无核荔枝A。 号与两个黑叶实生苗之间的相似性（与黑叶失是0．714，与黑叶圆是0．6）， 从而支持了用A；。号作砧本优于用黑叶作砧木的效果这一事实。并认为用海 垦4号、海垦13号（即缩练红）和海垦18号作砧木比用问 号作砧木嫁 接繁殖A．的效果可能更好。