谷子是我国重要的粮食作物之一,在我国农业生产中占有重要地位。种质资源的遗传多样性评价以及种质间的遗传关系研究可以为谷子的育种提供重要的基础信息。我国谷子地方种质资源十分丰富,这些地方品种中含有许多优异的基因资源,因此可以利用这些资源进行谷子种质改良和创新。本实验利用SSR自动荧光检测技术,分析了我国地方品种的遗传多样性水平和群体遗传结构,主要试验结果如下：1.利用覆盖谷子全基因组的77对SSR标记位点对262份谷子地方品种进行了遗传多样性分析,共检测到1281个等位变异,平均每个SSR位点为24个等位变异,基因多样性平均为0.8648,多态性信息含量(PIC)平均为0.8508,Shannon’s多样性指数平均为2.4525,表现出了较高的遗传多样性。2.本研究采用了基于遗传距离UPGMA算法和NJ算法两种聚类方法进行群体结构分析,两种方法所得的聚类结果基本一致。根据STRUCTURE软件给出的结果,将我国262份谷子地方品种划分为六个类群,其中组群Ⅰ包括33份材料,主要是来自东北平原黑龙江的材料；组群]Ⅱ包括31份材料,以淮南地区的种质资源为主；组群Ⅲ包括47份材料,主要是来自西北内陆和内蒙高原的材料；组群Ⅳ仅包括16份材料,主要是来自西藏的几份材料和来自国外的几个具有代表性的材料；组群V包括53份材料,以黄土高原最多；组群Ⅵ包含的材料数量最多,包括82份谷子地方品种,主要是来自东华北平原的材料,如辽宁、吉林、河北、北京、天津、河南、山东、江苏等省,以及与华北平原相邻的其他省份的部分地区。3.地方品种群体间的遗传多样性比较显示Pop6群体最大,平均等位基因数最多,基因多样性也最高,Pop3的多样性与Pop6相近；综合各项指标多样性最低的是材料数最少的Pop4。六个群体虽然包含的材料数量多少不一,但他们之间平均多样水平相差不大。4.通过计算群体间的遗传距离和相似系数发现,群体3和群体5之间的遗传距离最小,群体间的遗传分化系数Fst也最小,表明两个群体间最相近。而群体2和群体4之间的遗传距离最大,群体1和群体6之间的遗传分化系数最大。5.分子变异分析(AMOVA)显示,58.06%的遗传变异来自群体间,41.94%的遗传变异来自群体内部。所以本实验群体的变异来源主要来自群体间。6.在调查的12个农艺性状中遗传多样性指数最高的是株高,为2.0873；其次是茎长,为2.0749；最低的是穗松紧,为1.0033。其中在叶鞘颜色、穗松紧、穗型、刚毛长等4个性状中,各自性状所占的比例分布并不均匀,总是集中表现在某一特征上。7.通过对12个性状进行相关分析发现达到显著水平的共有30对性状,占总数的45.5%。其中,在正相关中,以穗粒重与穗重的相关系数最大,为0.900；相关系数最小的是穗长与穗型,为0，表现为不相关。在负相关中,负相关最大的是穗松紧与穗粗,相关系数为-0.329。其中分布在-0.300～0.300间的相关系数占总数的83.3%,这说明尽管部分农艺性状之间存在显著的相关性,但大部分性状间的相关系数较低。