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鲀形目(Tetraodontiformes)现存10科100属约350种,主要分布在热带和亚热带海洋,仅少数种类定居在淡水中,或在一定季节进入江河。鲀形目很多种类是重要的养殖鱼类和海洋捕捞对象,其中绿鳍马面鲀(Thamnaconus modestus)、黄鳍马面鲀(T.hypargyreus)等目前面临资源枯竭的困境。东方鲀属(Takifugu)鱼类近年来在水产养殖、河豚毒素医药开发、脊椎动物基因组研究方面有着广泛的应用,具有重要的经济地位、科研及医药价值,与此同时误食河鲀引起的中毒乃至死亡事件也时有发生。准确的物种鉴定不仅能有效地区分鲀毒鱼类,而且可以促进渔业资源合理开发、生态调查及生物多样性保护。但由于鲀形目鱼类外部形态总体差异较大,近缘种间十分相似,传统分类学多以条纹、斑点、体色等易受主观因素影响的形态特征作为主要辨别依据,以致至今鲀形目鱼类分类一直存在争议。DNA条形码通过对标准基因DNA序列的分析快速鉴定物种,已成功应用于动物、植物及微生物。本文测定了中国沿海8科19属33种110尾鲀形目鱼类线粒体COI基因5’端652 bp的序列,结合Gen Bank下载的序列,共分析了8科25属56种210条鱼类COI序列,旨在利用DNA条形码技术鉴定我国沿海常见的鲀形目鱼类,澄清目前分类的混乱,揭示可能存在的隐存种,并进行初步的系统发育分析,基于K2P替代模型的研究结果如下:(1)鲀形目亚目内科间、科内属间、属内种间、种内平均遗传距离分别为20.38%(18.59%-27.04%)、16.57%(0.89%-22.74%)、7.35%(0.03%-17.09%)、0.56%(0-5.41%),其中53种种内遗传距离小于2%的遗传距离阈值,48种种内遗传距离小于1%。56种鱼类种间平均遗传距离约为种内遗传距离的34倍,51种鱼类最小种间遗传距离大于最大种内遗传距离,在种内、种间乃至属间均无重叠,形成理想的DNA条形码间隙。但东方鲀属的鱼类可能受到种间杂交、近期辐射进化等干扰,墨绿东方鲀(T.basilevskianus)与红鳍东方鲀(T.rubripes)、双斑东方鲀(T.bimaculatus)与黄鳍东方鲀(T.xanthopterus)等未形成明显的DNA条形码间隙;而兔头鲀属(Lagocephalus)鱼类种间遗传距离已经达到鲀形目鱼类属间平均水平(16.57%),分类地位需要进一步研究。(2)在邻接树上鲀形目鱼类总体按物种名聚类,与形态学鉴定结果基本一致;属内能形成具有较高支持率的分支,但较高阶类群的系统发育关系不明确。除兔头鲀属(Lagocephalus)外,其余24个属均为单系。马面鲀属(Thamnaconus)的马面鲀(T.septentrionalis)与黄鳍马面鲀(T.hypargyreus)、东方鲀属(Takifugu)的铅点东方鲀(T.alboplumbeus)和斑点东方鲀(T.poecilonotus)可能存在同物异名现象。棘箱鲀(Kentrocapros aculeatus)、尖鼻箱鲀(Rhynchostracion nasus)、翻车鲀(Mola mola)等可能存在隐存种。