西瓜(Citrullus lanatus)起源于非洲南部的干旱地区,是一种在世界范围内广泛种植的园艺作物。我国是世界上最大的西瓜生产和消费国,西瓜的年产量达7千万吨。由于其经济价值的重要性,越来越多的育种者开始关注西瓜品质性状的研究。遗传连锁图谱的构建与相关性状的QTL分析是开展分子标记辅助选择育种的前期研究手段。本研究利用高通量测序技术对花园母本和LSW-177进行重测序,经过生物信息学分析,在基因组上寻找SNP位点,将其转化为CAPS标记,利用CAPS标记构建遗传连锁图谱,挖掘与果形、果皮厚度、单果重、可溶性固形物、果糖、蔗糖、葡萄糖相关性状的QTL位点。主要结果如下:1.花园母本和LSW-177在果形、果皮厚度和糖含量上均表现出极显著差异,在单果重上呈现出显著差异,符合亲本的选配原则,其重组自交系群体(RILs)表型数据的描述性统计分析结果表明这些性状均接近于正态分布,属于数量性状,可以用作QTL分析。2.F2S7代重组自交系群体表型数据的相关性分析结果表明,果形指数与果实长度呈极显著的正相关,与果实宽度呈极显著的负相关;果皮厚度与果实长度、果实宽度呈现出极显著的正相关,与果形指数呈显著的正相关;单果重与果实长度、果实宽度、果皮厚度呈极显著的正相关,与果形指数呈显著相关性。可溶性固形物与果糖、蔗糖、葡萄糖均存在显著正相关,果糖与蔗糖和葡萄糖均存在极显著正相关,但蔗糖与葡萄糖存在极显著负相关。3.利用生物信息学分析软件挖掘SNP位点,找到在亲本间有多态性的SNP位点352,483个,将其转化为CAPS标记,共开发CAPS标记524个,筛选出在亲本间有多态性的CAPS标记278个,多态率53.1%。利用这278个多态性引物对F2S7代125个家系进行标记,构建了一张西瓜的永久遗传连锁图谱,该图谱包含246个标记,11个连锁群,覆盖基因组长度2423.8c M,标记间平均距离9.9 c M。4.利用Windows QTL Cartographer V2.5软件进行QTL定位分析,通过对整个基因组扫描,共检测到与果形、果皮厚度、单果重、可溶性固形物、可溶性糖含量相关的QTL位点27个,其中与果形相关的QTL位点11个,主要分布在3号和8号连锁群上,贡献率在4.46%~71.41%之间;检测到控制果皮厚度的QTL 4个,分布在3号、7号和10号连锁群上,贡献率在7.19%~18.86%之间;检测到影响单果重的QTL 3个,分布在3号和8号连锁群上,贡献率在6.73%~16.34%之间;定位到控制可溶性固形物的QTL 4个,分布在2号、6号和9号连锁群上,贡献率在8.60%~32.10%之间;检测到控制可溶性糖含量的QTL 5个,分布在2号、6号、7号和9号连锁群上,贡献率在8.79%~24.10%之间。本研究建立了基于重测序数据开发CAPS分子标记的方法,并构建了一张CAPS标记遗传连锁图谱,通过对果实相关数量性状进行QTL分析,定位到果实性状相关的QTL位点27个,为今后西瓜的分子标记选择辅助育种提供了理论依据。