长角斑芫菁Mylabris（Pseudabris）hingstoni Blair,1927为青藏高原南部高海拔地区特有种,是研究青藏高原地质变迁和更新世气候变化对高海拔地区昆虫种群分化影响的理想材料。本文以该种为研究材料,采集地点涉及西藏自治区拉萨市、山南市及日喀则市共16个县40个地理种群,基于线粒体基因16S、COI和核基因ITS2序列片段为分子标记,采用单基因与多基因联合分析的方法,对长角斑芫菁进行种群动态演化分析,探讨其可能的演化路径,并比较不同分子标记的优劣性,为该物种系统发育提供分子方面的证据,也为青藏高原物种的形成与分化提供有价值的数据。本文所得结果如下:1)获得COI基因片段693 bp,16S基因片段401 bp以及ITS2基因片段295 bp,3个基因片段经串联共1389 bp;长角斑芫菁的3个单基因序列及联合基因序列均表现为A+T的含量高于G+C的含量,符合鞘翅目昆虫基因序列特征。在180条COI基因片段中检测到72个单倍型,其单倍型多样性为0.915;在175条16S基因片段中检测到35个单倍型,其单倍型多样性为0.566;在167条ITS2基因片段中检测到8个单倍型,单倍型多样性为0.127;在164条联合基因中共检测到100个单倍型,其多样性为0.967。可见分子进化速率越大,基因序列越长,检测到的单倍型多样就越高。本研究再次证明COI基因在探讨种群分化时较理想,是研究种及种下阶元的良好标记类型。16S和ITS2基因不适于探讨种级以下阶元的系统演化关系,而适用于探讨种级及以上阶元的系统演化关系。2)AMOVA分析表明,长角斑芫菁的16个居群的变异在居群内和居群间均有发生,可能与其地理距离有关。通过错配分布、中性检验、BSP分析、Max Ent模型预测和分子钟测年等一系列分析,结合地质历史事件和古气候变化,结果表明长角斑芫菁与长腹斑芫菁M.longiventris大约在1.954 Ma前发生分化,此时期正好为青藏运动的活跃期。而后,大约在0.321 Ma,前者分化成两个分支,推测主要可能是昆黄运动导致青藏高原的隆升及气候变化造成的,加之受自身的生境偏好性及迁移能力低的影响;其中一个分支主要分布在拉萨市和山南市,另一分支主要分布在日喀则市的西南部,而拉萨市、山南市和日喀则市接壤地段则表现为两个分支的混交带。在末次盛冰期（0.026–0.016 Ma）,长角斑芫菁退缩到北纬29°,东经88°–90°的狭小范围内避难。在全新世中期（9000–5000年前）气候变暖的情景下,长角斑芫菁开始向日喀则西部地区回迁。另外,在现代（1960–1990年）气候模式下,长角斑芫菁大量西迁的结果也说明了全球气候正逐渐变暖的现况。