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随着城市工业化的发展,湖泊污染现状日益严重,微生物是湖泊中物质循环和能量流动的重要参与者,微生物群落结构的变化与湖泊水质密切相关。本研究对武汉市城市湖泊东湖、南湖、汤逊湖2013年10月份、12月份,2014年2月份、4月份、8月份的pH、温度、氨氮、总氮、总磷、COD指标进行测定,运用综合营养指数法对三个湖泊进行评价,并运用PCR-DGGE技术对三个湖泊的细菌群落结构多样性进行分析。东湖水体综合营养指数随月份呈现规律性变化趋势为:10月份>8月份>12月份>2月份>4月份,10月份水体综合营养指数较大,为68.60,水体属于中度富营养化,4月份水体综合营养指数较小,为56.43,水体属于轻度富营养化。南湖水体综合营养指数随月份变化趋势为:12月份>10月份>8月份>2月份>4月份,12月份水体综合营养指数较大,为107.50,4月份水体综合营养指数较最小,为96.72,水体属于极重度富营养状态。汤逊湖水体综合营养指数随月份变化趋势为:10月份>12月份>8月份>2月份>4月份,10月份水体综合营养指数较大,为89.00,4月份水体综合营养指数较小,为73.81,水体属于重度富营养状态。2014年2月份东湖四个区域水体综合营养指数变化趋势为:D区域>A区域>B区域>C区域,东湖C区域水体综合营养指数较低为53.32,属于轻度富营养,东湖D区域水体综合营养指数较高为65.22,属于中度富营养,四个区域细菌数目与综合营养指数成正相关。南湖三个区域水体综合营养指数变化趋势为:南湖A区>南湖C区>南湖B区,南湖B区区域水体综合营养指数较低,为94.14,南湖A区区域水体综合营养指数较高,为107.31,三个区域水体属于重度富营养状态,三个区域细菌数目与综合营养指数成正相关。汤逊湖渔场区域和非渔场水体综合营养指数分别为93.41和72.21,表明渔场区域水体富营养化状态比非渔场严重,渔场区域细菌总数也高于非渔场区域。提取2014年2月东湖、南湖、汤逊湖不同区域的水样的细菌总DNA,以细菌16S r DNA V3区通用引物进行降落PCR扩增,产物进行变性凝胶电泳(DGGE)。东湖四个区域细菌群落结构多样性变化趋势与水体综合营养指数变化趋势一致,为D区域>A区域>B区域>C区域,D区域细菌多样性指数较大为3.0265,C区域采样点样品的香农指数较小为2.6955。南湖三个区域细菌多样性指数变化趋势和水体综合营养指数变化趋势一致,为A区>南湖C区>南湖B区,南湖A区的香农指数较大为3.2903,南湖B区香农指数较小为3.1439。汤逊湖渔场区域综合营养指数大于非渔场区域,渔场区域细菌多样性指数也大于非渔场区域,分别为3.1160和2.9458。三个湖泊不同区域水体细菌群落结构多样性指数的变化趋势与富营养化程度变化趋势一致。选取2014年4月南湖A区、南湖B区、东湖、汤逊湖各3个取样点进行PCR-DGGE,分析其细菌群落结构多样性。12个样品共检出29条位置不同的条带,样品的细菌多样性指数与水体综合营养指数变化趋势一致,为南湖A区>南湖B区>汤逊湖>东湖;特异性条带测序结果显示19个优势条带中,地位分类不明确的有11个,α-Proteobacteria、β-Proteobacteria、ε-Proteobacteria分别有1个,η-Proteobacteria有3个,Bacteroidetes有2个;典型对应分析表明湖水中微生物群落结构主要与氨氮(NH3-N)和总氮(TN)相关联。