我国海关缉私警察队伍成立五年来，在打击走私犯罪方面取得了令人瞩目的成绩。但随着国内市场的开放，外贸经营权的放开，境内外人、财、物的大流动，以及国内产业结构调整等因素，走私犯罪的形势变得日益错综复杂，走私犯罪分子对海关的各项法律法规和查处走私案件的做法熟知程度不断加深，不断变换走私手法，走私活动专业化、集团化、国际化日趋明显，尤其是在走私资金运作的账务处理方面手段更加狡猾，加大了查处走私案件的难度。在侦办走私案件的过程中尽快应用司法审计手段，是解决上述问题的必然选择。司法审计如何在海关缉私工作中应用是目前海关缉私部门亟待解决的重大课题。　　本文在对国内外司法审计的研究和发展状况进行综述的基础上，对司法审计的基本理论进行了研究。详细地分析了我国走私犯罪的现状和海关缉私队伍、工作中存在的问题，指出在海关缉私工作中应用司法审计方法，提高司法审计水平的重大意义。　　本文以司法审计的基本理论为基础，结合海关缉私工作的实际情况提出海关缉私司法审计的内容、目标、方法体系、工作技巧和工作程序。结合典型的一般贸易渠道走私犯罪案件、加工贸易渠道走私犯罪案件和减免税货物走私犯罪案件的特点，给出了不同类型案件司法审计的方法与程序。最后，结合当前海关缉私部门司法审计工作的现状，提出了提升海关缉私部门司法审计水平的对策。