高职院校是基础人才教育基地,承载着为国家培养基层高技能人才的使命,在促进国家的发展中发挥着越来越大的作用。高职院校的采购活动不仅能更好的实现学校教育的服务价值,也能为其教育管理、人才培养、产教融合、实验实训等提供可靠的保障。作为使用财政拨款的公益二类事业单位,高职院校在进行政府采购时要遵循相应的法律法规合理使用资金,因此高职院校政府采购的内部管理尤为重要。本文在对多所高职院校进行深度调研和分析的基础上,以采购流程、管理架构、内控管理制度等方面差异化特征为基础分为四种类型。通过调研了解四类院校政府采购工作人员在实际工作中遇到的重点难点,结合文献研究法、实证研究法和比较研究法,运用新公共管理理论、寻租理论和归因理论,就高职院校在政府采购内控管理过程中所面临的管理架构不清晰导致的岗位职能边界模糊、监管不到位、采购流程冗长、采购效率低下等问题进行深层次分析并提出相应的解决对策,包括明晰事权、强化内部监督,合理设岗、岗位权责对应,优化流程、重点管控。高职院校政府采购的内控管理优化,对学校的发展起到至关重要的作用,在理论上可以填补整个政府采购项目全流程管控中的内部控制管理上的空白,起到抛砖引玉的作用。