梨黑斑病病原菌致病力分化分析与链格孢病毒的鉴定

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梨黑斑病是我国南方梨产区的重要病害,本研究室前期研究证实导致梨黑斑病的病原菌优势种为细极链格孢(Alternaria tenuissima)和链格孢(A.alternata)。本研究进一步建立该病原菌的致病力室内快速测定方法,分析优势种群致病力分化状况,并通过高通量测序分析链格孢病毒种类多样性,对新型病毒进行系统鉴定。取得的主要研究结果如下:1.梨黑斑病菌致病力室内测定方法的建立。以代表菌株HB-36(A.tenuissima)、CQ-31(A.alternata)的菌丝块和分生孢子悬浮液为接种体,以离体翠冠叶片、枝条和黄冠梨果实为接种材料,比较不同接种方式的致病力测定效果。叶片接种显示,相同伤口处理下菌丝块接种的测定效果较接种分生孢子悬浮液稳定,且病斑扩展速度更快;果实接种显示,除6针处理后接种CQ-31菌株的菌丝块产生的病斑大于接种分生孢子液外,其余处理分生孢子液接种产生的病斑则均大于菌丝块;枝条接种菌丝块均未形成病斑。综合比较表明,以叶片经针刺3针处理后接种菌丝块的方法,更适用于梨黑斑病菌致病力的室内快速测定。2.梨黑斑病病原优势种群致病力的分化分析。采用建立的梨黑斑病菌致病力室内测定方法,对来源于重庆、湖北、四川、安徽、甘肃、陕西、江西、云南、山东共9个省市的146个菌株(其中细极链格孢72个、链格孢74个)进行致病力测定,并通过SAS软件对病斑平均直径进行聚类分析。结果显示,不同地域、梨种质和组织来源的菌株之间,其致病力类型与分布比例存在差异。其中,强致病力菌株17个、中等致病力菌株110个、弱致病力菌株19个,分别占供试菌株的12%、75%、13%。3.链格孢病毒种类多样性分析与新型病毒鉴定。利用高通量测序技术对来源于10个梨产区的6种链格孢的78个菌株进行宏病毒组分析,共发现24种病毒,其中属于+ss RNA病毒11种,ds RNA病毒8种,-ss RNA病毒5种。基于依赖RNA的RNA聚合酶(Rd Rp)序列系统发育分析明确了13种病毒的分类地位,分属于6个已知病毒科(Botourmiaviridae、Narnaviridae、Deltaflexiviridae、Partitiviridae、Chrysoviridae和Mymonaviridae)。从细极链格孢菌株HB-15中鉴定到2种-ss RNA病毒,分别是Alternaria sclerotimonavirus 1(ASV1)和Alternaria negative-stranded RNA virus 1(ANSRV1)。ASV1的基因组全长为9164 nt,包含5个线性排列的开放阅读框(ORFsⅠ-Ⅴ),其中ORFⅡ编码病毒的核衣壳蛋白(N),ORFⅣ编码病毒的复制酶(Rd Rp),并且经保守结构域预测,该蛋白具有一个和m RNA帽子结构相关的结构域。基于Rd Rp序列系统发育分析发现其与Mymonaviridae的Sclerotimonavirus的成员聚为一支。经透射电镜观察可看到线性的病毒粒子,直径约15 nm,长度约400 nm-1500 nm。从细极链格孢菌株SC-8中发现+ss RNA病毒,暂命名为Alternaria tenuissima deltaflexivirus 1(At DFV1)。其基因组全长8434 nt,包含4个开放阅读框(ORFsⅠ-Ⅳ),其中ORFⅠ编码聚合酶(Rd Rp),且有甲基转移酶保守结构域。对Rd Rp序列系统发育分析发现该病毒属于Deltaflexiviridae。通过比较脱毒与带毒菌株的菌落形态,发现无明显差异,但带毒菌株的致病力低且菌丝尖端弯曲。透射电镜观察发现球形的病毒粒子,直径约为15 nm。本研究明确了我国梨黑斑病菌两个优势种群的致病力分化状况及6种链格孢携带病毒的种类多样性,同时对发现的两种新真菌病毒系统鉴定,为梨黑斑病的研究和防控提供了相关技术方法和新的信息。
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