我国各类突发事件频发，给国家经济和社会的发展造成严重威胁和损害。应急指挥是应急处置的核心内容，关系着应急处置的效果和事件带来的损失大小。应急指挥流程是应急指挥功能实现的依托，反应着应急指挥过程中一系列活动的顺承关系。本文将应急指挥流程理解为静态组织机构和动态程序的结合，并从这两方面比较分析中国和美国的应急指挥流程。首先，在应急指挥静态组织机构方面，中美两国的应急指挥主体都表现出一定的分级响应特征，组织机构都表现出伸缩性和临时性；不同的是我国指挥主体间条块现象明显、指挥主体中社会参与不足、组织设置无标准规范，美国则重视建立不同部门间的协调机制，指挥组织设置也更为标准化。其次，在应急指挥动态程序方面，中美两国的应急指挥程序环节都由信息输入开始、以解散组织结束，也都需要人、财、物、信息等要素的保障；不同的是我国指挥程序中的指挥协调环节界定模糊、要素保障的技术支撑和机制建设等方面尚且不足，美国应急指挥协调使用目标管理的方法且行动由计划做支撑，要素保障使用先进技术做支撑，建立了一系列要素保障机制并积极推动社会力量参与。通过对比中美应急指挥流程的异同，结合中国目前应急管理现状，提出了四点可能的借鉴之处：建立标准化的应急指挥组织模式，完善指挥组织协调机制，规范应急指挥流程环节，建构完善的应急指挥要素保障体系。