原核核糖体组装相关的GTP酶YihA的结构与机制研究

来源 :清华大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:achm207
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
核糖体所催化蛋白质的生物合成是细胞内一切生命活动的基础。核糖体自身的组装也是一个重要的生长调控过程。已知一些核糖体依赖的GTP酶参与核糖体的组装,并且对细胞周期的调控有着关键的作用。YihA是细菌中广泛存在的一种生长必需的GTP酶,参与核糖体大亚基晚期的组装。本论文结合冷冻电镜三维重构学和生物化学的方法,探究了大肠杆菌YihA蛋白的分子机制及其结构基础。首先,本论文研究了大肠杆菌YihA蛋白与核糖体在体外的相互作用。实验结果表明YihA在体外与核糖体50S亚基有较强的相互作用,在核苷酸存在的条件下其亲和力进一步提高,核苷酸的促进作用强弱顺序为:GMPPNP>GDP>GTP。在此基础上,我们利用冷冻电镜三维重构的方法解析了在GMPPNP和GDP两种核苷酸状态下,YihA蛋白与成熟的50S亚基的复合体结构。结构数据显示,YihA结合在50S和30S的重要中间桥梁H69处,同时YihA蛋白的结合直接导致23S rRNA的保守序列H68-71发生大幅度的构象变化。这些数据表明YihA的结合使成熟的50S亚基退回到了其晚期成熟过程中的某个中间状态。其次,根据结构得到的信息,我们进一步检测了YihA和rRNA的不同片段的结合作用。体外转录的23S rRNA的H68-71序列可以和YihA蛋白在体外相互结合,从侧面验证了冷冻电镜结构的数据。通过对YihA基因特异的转座子插入突变菌的分析表明,YihA功能的异常会引起核糖体50S亚基成熟的缺陷,细胞内积累不成熟的50S。这个沉降系数约为45S的中间体,相对成熟的50S显示出部分缺失的蛋白和部分额外多出的蛋白。最后,为了进一步探究YihA的N端序列和C端序列对YihA蛋白的功能影响,我们构建了YihA的截短突变菌。体外结合实验和冷冻电镜三维结构共同显示出,N端的15个氨基酸的非GTP酶结构域序列和C端高度带电的30个氨基酸序列对YihA的功能都具有重要的作用。综合本论文的研究结果和目前已有的其他研究结果,我们第一次提出了YihA蛋白在50S成熟晚期过程中可能的分子机制。YihA在50S成熟晚期,可能作为RNA的分子伴侣对H68-71的折叠有重要作用。此外,其结合在H69位点处,很有可能是作为一个质量调控点以阻止未成熟的50S进入翻译途径。在50S成熟晚期过程中,23S rRNA的长螺旋H68-71的折叠可能是一个关键的限速步骤。
其他文献
如何让绘画活动更加有趣,使简单的线条,多变的色彩,为孩子们插上想象的翅膀,而展现出一个丰富神奇的童心世界。本文从幼儿艺术教育的视角分析、探讨了发展幼儿绘画能力的方法
随着互联网行业和深度学习技术的快速发展,自然语言处理领域取得了前所未有的进展。自然语言推理在大数据的背景下取得了丰硕的成果,文本相似度分析是自然语言推理中一项基本
脉冲星是高度磁化的旋转中子星,具有体积小、密度大等特点。脉冲星的发现在物理和天文学领域都有着重大的意义。随着人工智能技术的发展,基于深度学习的图像识别方法被越来越
本研究选取上海浦江郊野公园内5种典型林分香樟林(Cinnamomum cam phora)、栾树林(Koelreuteria paniculata)、桂花林(Osmanthus fragrans)、无患子林(Sapindus mukorossi Gaertn)、池杉(Taxodium ascendens Brongn)林为对象,结合公园实际特点和操作的可行性,选择调节水量、固碳释氧、保持土壤肥力、
龙椒15号是利用辣椒雄性不育三系育成的一代杂种。不育系16A和恢复系07-23C从韩国金塔辣椒F2代中分离。龙椒15号辣味适中,色素含量高,主要适于加工干制,适于有效积温2 300℃