蛋白质顺磁标记中探针的设计、合成与表征

来源 :南开大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:yigeyige
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
X-射线晶体衍射和核磁共振是研究生物大分子三维结构的两种主要技术手段,与X-射线晶体衍射相比,核磁共振在某些方面具有明显的优势,比如:样品不需要结晶,可以在接近生理条件下进行探测,可以用来研究生物大分子在溶液中的空间结构和功能的关系及生物样品中的动态行为等等。传统核磁共振主要用NOE (Nuclear Overhauser Effect)及二面角作为结构限制条件,然而,在研究蛋白质-蛋白质,蛋白质-配体相互作用时,一般情况下获得分子间NOE较为繁琐;另外,在研究多结构域的生物大分子的结构时,由于传统核磁共振只能提供短程的结构限制,很难获得结构域之间的结构信息,传统核磁共振在解决以上问题时遇到较大的挑战。与传统的核磁共振相比,顺磁核磁共振能够提供长程的结构限制,在分析大蛋白的溶液构象变化,蛋白质-蛋白质或配体相互作用等方面具有明显的优势。通常情况下蛋白质不含顺磁中心,要获得顺磁性结构信息需要对蛋白质进行顺磁标记,为解决目前国际上在蛋白质顺磁标记方面面临的问题譬如二硫键的不稳定性、标签的体积与刚性,本人设计合成了一系列新型的顺磁探针并进行了蛋白质的修饰,另外还探讨了巯基和碳碳双键的Michael加成反应的动力学。本文主要研究内容如下:设计合成了一系列的含双功能团的顺磁标签,通过合理的路线,以较高的收率合成一系列含有活化的碳碳双键(Michael受体)的顺磁标签;通过紫外可见分光光度计研究了顺磁标签L1和L2和L-半胱氨酸的反应动力学。结果发现,L1在中性水溶液中,不需要任何自由基引发剂的情况下,和L-半胱氨酸反应良好,并且L1具有明显的巯基选择性,和赖氨酸、甲硫氨酸等含官能团的氨基酸均不反应。L2与L1相似,但是L2与L-半胱氨酸的反应慢,这为根据巯基活性不同选择性标记含有多自由巯基的蛋白质提供了可能;针对二硫键容易发生置换及在高pH和还原环境下不稳定的问题,本实验首次利用麦克尔加成的方式把顺磁标签连接到蛋白质上,巯基麦克尔加成形成稳定的巯醚键,与二硫键相比,巯醚键在高pH及还原性环境下均能稳定存在。实验发现,L1和Ubiquitin-T22C或ArgN连接以后,滴加顺磁金属离子,均获得高质量的顺磁图谱;针对L1配位数少的问题,设计合成了L2顺磁标签,和L1相比,L2和镧系金属离子的络合能力更强,L2和Ubiquitin-G47C连接以后,滴加顺磁金属,大部分氨基酸残基有明显的赝接触化学位移。
其他文献
该论文主要展示了我在攻读博士学位期间所做的一些工作。论文的主要工作包含两项:一是在时间域中发展和完善了包含振动能级贡献的电子谱和共振拉曼光谱的微分截面的数学表达,
手性现象在自然界中普遍存在。不同立体构型的对映异构体往往表现出不同甚至相反的性能。获得光学异构体纯手性化合物在生物学、化学、药学、农业或非线性光学材料行业都非常
该文在总结作者多年来对高师生和在职中小学教师进行信息化教学设计能力培训的经验的基础上,提出了网络环境下信息化教学设计的新思路,并从教学应用和技术的层面进行了分析和探
寻找地外生命,首先是寻找“适合生命存在”的宜居行星,对此目前还是以地球生命的生存条件为评判标准。火星与木卫二,有生命存在的呼声都很高,但这两个星球的环境迥然不同,很难说哪
随着酶促反应研究的发展,酶在有机合成中显示出越来越重要的作用。因而,探索酶催化的多功能性,调控酶促反应以及基于酶促反应设计的串联合成方法激发了化学家们研究的兴趣。
金属-有机配位化合物由于其结构的多样性和可调控性以及在催化、磁性、气体分离与吸附、非线性光学等诸多材料领域有着优异的潜在应用前景,已经成为近二十年来无机化学领域发
目的了解念珠菌性阴道炎致病菌的菌种分布情况及耐药情况。方法对念珠菌性阴道炎患者的标本运用玛嘉显色培养基法对分离自阴道念珠菌感染患者的383株念珠菌进行菌种鉴定。结