一株杆菌产脂肪酶基因的克隆及生物信息学分析

来源 :大连工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jackieWXM
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脂肪酶(EC3.1.1.3)全称为三脂酰甘油酰基水解酶,是一类催化油脂水解的水解酶,广泛存在于动物、植物和微生物,可催化酯交换、醇解、酯化酸解等反应,已广泛应用在食品加工、医学、洗涤业、纺织等领域。近年来,来源于微生物的脂肪酶的性质及其在工业的应用倍受关注,采用基因工程技术构建重组工程菌,提高相应脂肪酶的表达量,对相关工业的发展有着重大的意义。本课题从鞘氨醇杆菌Sphingobacterium. sp中克隆出脂肪酶基因片段,通过对其进行测序及生物信息学分析,希望对脂肪酶的应用提供理论依据。主要结论包括:1.用试剂盒法提取Sphingobacterium.sp基因组DNA,利用Primer Premier5.0软件设计特异引物,从Sphingobacterium.sp基因组DNA扩增脂肪酶基因片段,优化了扩增体系。2.用PCR技术从Sphingobacterium. sp基因组DNA扩增出一大约800bp的DNA片段Lip-J,与预期的大小相符。回收目的DNA片段并将其克隆到2EASY-Blunt Simple载体中,转化大肠杆菌JM109感受态细胞,获得重组质粒后再次进行特异性引物扩增鉴定后,证明重组质粒中含有我们扩增出的目的片段,将重组质粒送去测序。3将测序结果进行分析并构建进化树,分析结果表明Lip-J基因片段全长为761bp,正向插入到了pEASY-Blunt Simple载体中,含有一个长为639bp的开放阅读框。与其他菌的脂肪酶基因进行序列比对,与Bacillus subtilis脂肪酶基因一致性35.89%;与Bacillus stearothermophilus脂肪酶基因一致性为37.44%,综合结果可以得出Lip-J为脂肪酶基因片段。4将Lip-J基因片段进行生物信息学分析表明,其拟表达蛋白质的分子量为29416.9Da,等电点为5.12,为酸性蛋白质。负电荷残基(Asp+Glu)总数为27,正电荷残基(Arg+Lys)总数为24。不稳定系数为37.39,总平均亲水数为-0.381,为亲水性稳定型蛋白。结构预测表明该片段中α-螺旋占15.1%、β-折叠占34.0%、无规则卷曲占50.1%,无跨膜结构和信号肽存在。
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