【摘 要】
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蜂巢珊瑚科(Faviidae)是印度-太平洋区系仅次于鹿角珊瑚科的第二大造礁石珊瑚科,其种类丰富,生态型多,变异大,依靠传统形态学的鉴定难度大,本次实验利用两种线粒体DNA分子标记(COI和COI-tmM)和两种核DNA分子标记(ITS和Pax-C)对海南蜂巢珊瑚科6个属18种珊瑚进行一系列分子分类和系统进化研究,基于4种分子标记序列分析,结果显示:(1)基于核DNA分子序列的遗传多样性均高于线粒
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蜂巢珊瑚科(Faviidae)是印度-太平洋区系仅次于鹿角珊瑚科的第二大造礁石珊瑚科,其种类丰富,生态型多,变异大,依靠传统形态学的鉴定难度大,本次实验利用两种线粒体DNA分子标记(COI和COI-tmM)和两种核DNA分子标记(ITS和Pax-C)对海南蜂巢珊瑚科6个属18种珊瑚进行一系列分子分类和系统进化研究,基于4种分子标记序列分析,结果显示:(1)基于核DNA分子序列的遗传多样性均高于线粒体COI,而COI-trnM的核苷酸多样度和可变性位点高于ITS和Pax-C,但其单倍性多样性低于ITS和Pax-C。(2)系统进化分析显示,ITS可将蜂巢珊瑚科各属显著分开,并将少部分种细分,或将属内几个种再归为小系群。核Pax-C较ITS分类能力略低,但发现该基因的粗糙菊花珊瑚的基因多样性非常丰富。线粒体标尺COI-trnM分属能力也很好,虽不能将秘密角蜂巢珊瑚和梳状菊花珊瑚分开,却能单独鉴定出粗糙菊花珊瑚。而COI在蜂巢珊瑚科中只可将科内大部分属分离。(3)蜂巢珊瑚科部分属间及属内种间存在并系发育。基于4种分子标记的系统发育分析,菊花珊瑚属的过渡性分类地位引起其属间的并系发育,蜂巢珊瑚属和扁脑珊瑚属的属内种间存在并系发育,梳状菊花珊瑚和少片菊花珊瑚之间也存在并系发育。(4)比较分析进化树图和单倍型中介网络图发现,蜂巢珊瑚科珊瑚的分子分类和系统进化结果基本一致,两者对于分子系统进化研究都有很好指示作用。(5)蜂巢珊瑚科形态分类和分子分类具有一致性,但并不完全一致。且这种相关性往往是与选择的分子标记有关的。
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