mir-452-5p在非小细胞肺癌中的临床意义及潜在靶向机制研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:rebornfdgg
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肺癌长年位居全世界恶性肿瘤中发病率及死亡率的首位,至今也未能得到有效的控制和改善。肺癌最常见的病理组织学类型主要为肺腺癌与肺鳞癌。MicroRNA通过其靶向调控功能在肿瘤发生发展中起重要作用,但miR-452-5p在肺癌中的作用及机制尚不清楚,对其系统深入地研究将对肺癌的诊断与治疗有重要意义。  目的:  1.证明miR-452-5p在肺腺癌中的表达水平与临床意义  2.证明miR-452-5p在肺鳞癌中的表达水平与临床意义  3.探索说明miR-452-5p的潜在靶向作用机制  方法:  1.本研究采用实时定量PCR(real time RT-qPCR,quantitative real time polymerase chain reaction)检测101例肺腺癌患者的石蜡组织标本中miR-452-5p的表达水平,分析miR-452-5p表达与肺腺癌患者诊断、预后及临床病理特征间的关系。并通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)与Gene Expression Omnibus(GEO)公共数据库进一步确证miR-452-5p在肺腺癌中的表达水平。  2.利用TCGA实验数据分析miR-452-5p的表达及其与肺鳞癌患者诊断、预后及临床病理特征间的关系。通过TCGA与GEO公共数据库进一步确证miR-452-5p在肺鳞癌中的表达水平。  3.应用14个在线预测工具(miRWalk,TargetScan,miRanda,Pictar2,RNAhybrid,miRDB,RNA22-HAS,Targetminer,EMBL-EBI,DIANA-microT,mirbridge,miRMap,miRNAMap及PITA)来预测miR-452-5p的靶基因。结合DAVID和GSEA在线软件,对miR-452-5p的靶基因进行GO和KEGG通路富集分析,以探明其在非小细胞肺癌生物学进程中可能的分子作用机制。通过STRING在miR-452-5p的潜在靶基因中,筛选出在蛋白分子相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)中起关键作用的核心基因(hub gene)。  通过分析TCGA测序数据来验证miR-452-5p与hub gene之间的表达相关性。之后,通过荧光素酶报告基因实验,进一步证实miR-452-5p与核心基因CDKN1B的靶向关系。  结果:  1.肺腺癌中miR-452-5p的表达情况及其临床意义  检测发现miR-452-5p在肺腺癌组织中表达明显低于相应癌旁组织(2.2952±1.4518vs.5.3319±3.0569,P<0.001)。受试者工作曲线(ROC),曲线下面积(AUC)为0.855[95%confidence interval(CI):0.805~0.906,P<0.001],敏感性85.1%,特异性76.2%,诊断界值为2.80。miR-452-5p表达水平与肺腺癌患者的肿瘤大小(r=-0.243,P=0.014),淋巴结转移(r=-0.214,P=0.032)及TNM分期(r=-0.209,P=0.036)呈显著负相关。  TCGA数据分析结果显示miR-452-5p在肺腺癌组织中相对癌旁肺组织低表达(8.3539±1.40738vs.8.7608±2.06101,P<0.001),AUC为0.678(95%CI:0.587~0.769,P<0.001)。联合GEO数据库结果,通过meta分析进一步得出miR-452-5p在肺腺癌中低表达[平均标准偏差(standard mean deviations,SMD)=-0.393,95%CI:-0.774~-0.011,P=0.044]。  2.肺鳞癌中miR-452-5p的表达情况及其临床意义  分析TCGA数据,发现miR-452-5p在肺鳞癌组织中相对癌旁肺组织高表达(7.1525±1.39063vs.6.0885±0.35298,P<0.001),AUC为0.778(95%CI:0.734~0.821,P<0.001)。另外,miR-452-5p表达水平与肺鳞癌患者的年龄(r=-0.187,P=0.001)和TNM分期(r=-0.119,P=0.028)呈显著负相关。联合GEO数据库结果,通过meta分析进一步得出miR-452-5p在肺鳞癌中高表达(SMD=0.372,95%CI:0.020~0.724,P=0.038)。  3.miR-452-5p的潜在功能与机制  通过14个在线预测软件,对miR-452-5p共预测得到17094个候选靶基因。选取同时有7个在线预测工具阳性结果和在pubmed中检索文献得到的已通过实验验证的miR-452-5p的靶基因,共筛选出249个miR-452-5p靶基因进行GO及pathway分析。  GO功能富集分析结果表明在17条显著富集于生物学过程(biological process,BP)的通路中(P<0.01),miR-452-5p的靶基因最显著富集的3条通路包括:RNA聚合酶Ⅱ介导的正向转录调控(GO:0045944~positive regulation of transcription from RNA polymeraseⅡpromoter,P<0.001);联合神经元的轴突导向(GO:0071679~commissural neuron axon guidance,P<0.001);DNA为模板的转录调节(GO:0006351~transcription,DNA-templated,P<0.001);在7条显著富集于细胞组成(cellular components,CC)的通路中(P<0.01),miR-452-5p的靶基因最显著富集的3条通路包括:胞核核浆成分(GO:0005654~nucleoplasm,P<0.001);胞核核仁成分(GO:0005634~nucleus,P<0.001);胞质囊胞膜成分(GO:0030659~cytoplasmic vesicle membrane,P=0.001)。在14条显著富集于分子功能(molecular function,MF)的通路中(P<0.01),miR-452-5p的靶基因最显著富集的3条通路包括:蛋白质分子的结合(GO:0005515~protein binding,P<0.001);染色质的结合(GO:0003682~chromatin binding,P<0.001);锌离子的结合(GO:0008270~zincion binding,P<0.001)。  KEGG信号通路分析结果表明miR-452-5p靶基因显著富集于10条信号通路(P<0.05);其中最显著富集的前3条通路包括:干细胞多能性调节的信号通路(hsa04550:Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells,P=0.002);卵母细胞减数分裂(hsa04114:Oocyte meiosis,P=0.003);细胞周期进程(hsa04110:Cell cycle,P=0.005)的疾病相关通路中。  在PPI网络中筛选出10个hub genes,其中5个hub genes,包括SMAD4,SMAD2,CDKN1B,YWHAE和YWHAB,显著富集于细胞周期通路。通过TCGA中的RNA测序数据的相关分析显示,miR-452-5p在肺鳞癌中的表达与CDKN1B表达呈显著负相关。荧光素酶报告基因实验结果显示,miR-452-5p可靶向调控CDKN1B基因的表达。  结论:  本课题发现miR-452-5p在非小细胞肺癌中表达存在组织特异性。miR-452-5p在肺腺癌组织中低表达,并且与肺腺癌患者的临床病理参数包括肿瘤大小,淋巴结转移,TNM分期呈负相关;miR-452-5p在肺鳞癌组织中高表达,并与肺鳞癌患者的年龄及TNM分期呈负相关。miR-452-5p可能靶向细胞周期通路中的CDKN1B基因在非小细胞肺癌的发生发展中起关键作用。在我们研究的基础上,通过体内、体外实验进一步阐明miR-452-5p在NSCLC相关通路的靶向调控机制及功能,这可能为非小细胞肺癌的早期诊断和分子靶向治疗提供新的线索。
其他文献
一、现阶段高校房改房二级市场扩大的制约因素rn(一)原产权单位是房改房上市交易的主要障碍之一.
高校后勤“社会化”改革的推进,使之最终将成为独立的企业.从学校母体中剥离出来的后勤,已不可能再完全依赖学校的校园文化.建立具有后勤特色的后勤文化,是使后勤真正能够做
2004年的暑期,人大校园较之平时要宁静许多,然而后勤集团学生服务中心的办公室里却是热火朝天,中心的全体工作人员正紧锣密鼓地策划着我校历史上规模最大的一次宿舍调整工作
“民以食为天,食以安为先”.多年来,山西大学按照“重在建设,狠抓管理,务求实效”的工作思路,不断加强食堂基础设施建设,强化饮食卫生安全的管理和服务工作,加大监督检查力度
近年来,洛阳师范学院坚持基本建设与绿化同步规划,建筑与环境美化协调发展的指导思想,先后建成了透绿游园、住宅区游园、逸夫楼游园等绿色生态园林区,进一步改善了校园环境,
最近在收看中央电视台体育频道直播2011年瑞士女排精英赛时,意外发现央视的台标被移到了电视画面的右上方,而把观众最关心的比分放在了左上方,把比赛双方的队名放在了右下方
籼型水稻“B型莲源早”不育系的不育类型属配子体不育,杂种后代无育性分离,表现全可育。在单株植(一粒种子苗)情况下,参试的3个杂交组合的F_1都具有较大的产量优势,F_2仍保持
坚持姓“教”的企业特色,处理好社会效益和经济效益的关系rn后勤集团作为企业,可以在市场上按经济规律独立运作,但我们清醒地认识到,它是一个特殊的产业,即主要为教育服务,为
福云六号是适合我县种植的优良品种。1973年玛坑乡茶场从福安社口引进小面积试种后,又在七步、纯池、赤岩、川中等乡、村茶场和茶叶重点户中进行多点推广试种,表现很好,是我
1979年,CIMMYT的报告中提出,大麦黄矮病毒(BYDV)病是小黑麦的一种主要病害,但在这以前,科学家们对此病很少注意.当时,加拿大的魁北克省是不种小黑麦的,小黑麦的收集鉴定仅仅