毛竹（Phyllostachys edulis）为禾本科（Gramineae/Poaceae）竹亚科（Bambusoideae）刚竹属（Phyllostachys）竹种，集经济、社会、生态价值于一身，是我国栽培历史最长、栽培面积最大、开展研究最多的最重要经济竹种。毛竹有着特殊的生物学特性，它既能通过强大的地下茎（竹鞭）进行无性繁殖，又能开花结实进行有性生殖。但是，毛竹的开花周期长、结实率低、开花时间不确定等因素，使得毛竹的有性生殖研究困难。目前，毛竹有性生殖研究集中在花实发育解剖、种实产量与育苗等，本文在毛竹开花多年野外实地观察的基础上，开展了毛竹子代父本来源分析，选择一株母竹，搜集其种子，以母株为圆点，划分四个象限，选择25株候选父本，进行母株种子的父本来源研究；同时，在该林分中，选择10株未开花的毛竹单株，分析了候选父本、子代的遗传多样性，开花与未开花株的基因型；对多年多点保存的毛竹自由授粉的种子开展育苗试验，进行种质挖掘。得出了以下主要结论：（1）采用父本分析软件CERVUS3.0，运用SSR分子标记，研究了开花毛竹林中基于25个候选父本的100份自由授粉子代的父本来源。从50对SSR引物中筛选出多态性较好的9对引物，共检测到18个等位基因（NA），平均观测杂合度（Ho）为0.0649，期望杂合度（He）为0.3001，多态信息含量为（PIC）0.235。遗传多样性分析可见，子代的遗传多样性高于亲本的遗传多样性，有性杂交可以提供后代遗传多样性。研究未能检测出子代的父本来源，根据毛竹的繁育特性，可能由于父本具有相同遗传背景，为同一无性系来源；或者是由于所选用的PBM020等SSR引物的鉴别能力的问题所致，造成无法明确子代的真实父本，此还值得深入研究。（2）多年野外调查发现，毛竹盛花期为每年的6月中、下旬，或早或晚开花的毛竹因天气等原因难于结实。开花时间以上午8:30~10:30为主，下午15:00~16:30是第二个高潮，在这段时期内，毛竹林分内有大量蜜蜂造访，咬噬花粉管，表明毛竹除风媒授粉外，还有虫媒授粉机制，其传粉生物学特征有待深入研究。（3）采用SSR分析了同一林分中互错的25株开花和10株未开花毛竹单株的基因型，未能发现两者基因型的不同，而却出现了开花与未开花2种表现类型，未开花植株随后3年的观察也未见开花，证明试验地毛竹林分存在有世代重叠的现象，仅生殖成熟的株系开花。（4）对207个株系的毛竹种子进行播种育苗，分别测定F1代种质在表型、生理、分子三个层次的遗传变异程度。F1代在苗高、分蘖株数、发笋量、叶长、叶宽等表型参数间存在着丰富的变异，是种质发掘的基础。F1代的初始荧光参数（F0）、PSⅡ在最大光化学量子产量（Fv/Fm）、量子产量（Yield）、非光化学淬灭系数（qN）、光合电子传递速率（ETR）等生理指标间的差异达到极显著水平，且存在着丰富的变异，其中，qN的变异幅度最大，可以作为早期选择的优先指标。对F1代29份毛竹(1份桂竹作外类群)的AFLP分子鉴别结果显示，种质间存在丰富的遗传变异，种质的遗传相似性系数范围为0.76~0.91，经UPGMA聚类分析，可聚集具有不同遗传基础的种质。（5）数理统计分析结果表明，毛竹F1代的表型性状与荧光参数之间具有明显相关性。苗高与F0、Yield、ETR呈显著正相关，分蘖株数仅与qN显著负相关，发笋数量与Yield、ETR成极显著正相关，与F0、 Fv/Fm、qN不相关，叶长、叶宽分别与F0极显著正相关，与ETR显著正相关，与qN显著负相关。（6）综合表型、生理及分子证据，在毛竹F1代中，选育出‘高大上’、‘阳光小子’、‘花样少女’、‘子孙满堂’等4份特异/优异种质。提出了以表型性状为基础，生理性状作验证、分子性状为保证的竹类植物种质创制新方法。