随着“创新”在十四五规划和更长远的规划被摆在了核心地位,医药制造业提升创新能力以及创新产出也成为了各大医药头部企业首要目标,我国医药制造企业目前正处于“仿制药”转向“创新药”的转型期,然而研发新药将要面临超高的研发成本以及不确定的研发风险是必然的。为了有效降低科技型企业的研发成本以及研发风险,我国政府在1996年正式推出研发费用加计扣除政策,2021年的政府工作报告中将制造业企业加计扣除比例提高到100%。但是研发费用加计扣除政策能够给企业创新绩效带来什么影响,并通过什么路径对创新绩效造成影响都亟待研究。基于以上问题,本文以恒瑞医药为例,展开了研发费用加计扣除政策对企业创新绩效影响机制与研发费用加计扣除政策对企业创新绩效影响的效果的深入分析。研发费用加计扣除政策的实施目的是为了促进企业加大研发投入,进而影响企业的创新绩效,为探究这一政策对企业创新影响具体的作用机制,本文首先对研发费用加计扣除政策制度背景以及核算要求进行了梳理,并从不同视角对制造业研发费用加计扣除整体实施效果进行了分析。接下来,本文对我国医药行业发展现状以及整体的研发费用投入及研发强度情况做出了简介,并引出了本文案例企业——恒瑞医药。针对本文案例企业,首先对研发费用加计扣除政策对恒瑞医药创新绩效的影响机制展开多角度分析。研究结果发现:从增加企业研发投入的作用机制来看,研发费用加计扣除政策通过作用于企业加大研发费用、研发项目投入、研发人员对企业创新绩效产生正向积极。从降低企业税费成本的作用机制来看,研发费用加计扣除政策对于企业税费的减免作用效果显著,能够有效地为企业降低成本。其次,本文对加计扣除政策对恒瑞医药创新绩效的影响效果展开多层次分析。通过使用熵权TOPSIS法,构建了与恒瑞医药适配度高的创新绩效评价体系,对恒瑞医药及其对比企业进行排名,并结合恒瑞医药各项财务指标变化以及专利申请情况分析加计扣除政策对恒瑞医药实质经营的影响。研究发现,研发费用加计扣除政策能够通过提升企业的研发创新意愿,加大企业的研发投入,从而能够对企业实质经营提供帮助。最后本文结合恒瑞医药企业自身的实际情况从政策角度和企业角度提出了具体建议,希望能够为完善政策以及同行业企业提供有效参考。