进入21世纪，高校承担的科研项目越来越多，与之相应科研经费也逐年递增，科研经费管理问题也随之成为高校财务管理的重中之重。预算管理作为科研经费管理的核心，在财务管理中更是占有重要地位。因此，研究优化高校科研经费预算管理模式，对于提高科研经费的使用效率，推进高校科研工作健康快速发展具有重大意义。本文在查阅大量相关文献资料，借鉴发达国家先进的科研经费预算管理经验的基础上，以C高校为研究对象，运用案例研究、文献研究等方法，描述了C高校科研经费预算管理基本情况以及实施机制的现状，分析发现C高校科研经费预算管理工作中缺乏完善的预算管理制度,在科研经费预算的编制、审核、执行、控制、考核等环节仍然存在一些突出的问题，针对这些问题本文从完善预算管理制度、健全科研经费预算的管理机构、完善科研经费预算的编制流程、建立预算评审机制、实行预算执行动态监控及绩效考核管理等方面提出了优化C高校科研经费预算管理模式的建议。本文的研究不仅可以建立具有较强针对性的、适合C高校实际情况的科研经费预算管理体制，极大提高该校科研经费预算管理水平，还可为其他高校完善科研经费预算管理提供理论上的借鉴，对科研经费体制改革也具有一定的理论指导意义。