构建TALEN文库用于基因编辑及用CRISPR/Cas9特异性敲除乙型肝炎病毒cccDNA

来源 :南京大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lullm
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
小鼠和人类在基因组的大小,基因的数目以及基因组的结构等方面具有很大程度的相似性。很多基因在小鼠和人类中具有高度的保守性,因此,可以利用小鼠基因敲除模型来研究人类基因的功能,从而为人类疾病的治疗提供理论基础。在小鼠里,传统的基因打靶方法需要构建同源打靶载体,电转小鼠ES细胞,经过正负筛选,找出正确的克隆,注射到小鼠囊胚中,得到的嵌合小鼠需要把这种正确的打靶遗传到下一代,才算成功得到基因打靶小鼠,整个过程耗时1-2年,需要多个操作步骤,成本很高。因此,新的不依赖ES细胞、高效安全的基因编辑方法亟待开发。TALEN是由TAL effector及Fok1融合而成,TAL effector是在黄单胞杆菌中发现的一种转录激活样的效应因子,其蛋白比较特殊,中间部位是由重复序列RVD组成,每个RVD都由34个氨基酸构成,只有第12和13位的氨基酸不同,正是这两个氨基酸的不同,导致每种RVD可以识别不同的碱基,多个RVD串联起,就可以识别多个碱基,融合Fok1的TALEN形成dimer后,会切割DNA,造成DSB。传统构建TALEN质粒的方法存在一些不足,例如Golden Gate法用于构建TALEN质粒顺利的话至少要花费5天的时间才能得到正确的克隆,并且需要重复的进行挑克隆,PCR验证的步骤,耗时耗力。这里,我们成功地构建出了一套TALEN文库用于快速高效地构建TALEN质粒。与Golden Gate法相比,减少了一半的时间,简化了操作步骤,更加有利于TALEN技术的广泛使用。并且,利用这套TALEN文库系统,我们成功地得到了Cntn 基因敲除小鼠。同样,CRISPR/Cas9系统也是一种新颖的基因组改造工具,它来源于细菌和古细菌的获得性免疫系统,用以对抗入侵的病毒和质粒。Type Ⅱ CRISPR/Cas系统是三个类型中最为简单的一个,由CRISPRRNAs(crRNAs),trans-activating crRNAs(tracrRNAs)和 Cas9 DNA 内切酶组成。成熟的 crRNAs:tracrRNA 复合物指导Cas9对双链DNA的切割。为了简化这个系统,将crRNAs和部分tracrRNA融合成一条嵌合的sgRNA链。目前,CRISPR/Cas系统已经成功地应用于人类细胞和许多模式生物的基因组改造。这里,我们利用CRISPR/Cas9系统特异性地敲除HBV cccDNA。为了提高系统的特异性,我们使用CRISPR/Cas9切口酶和成对的sgRNAs,两个相近的切口可以造成DNA双链断裂,诱导细胞发生非同源末端连接修复,引入突变,而脱靶位点几乎只会形成一个切口,但是基因组上的切口可以通过碱基切除修复方式完美修复。我们针对HBV设计了四对sgRNAs,在293T和HepG2细胞中共转染Cas9,成对的sgRNAs和HBV表达载体payw1.2质粒。payw1.2质粒含有1.2个HBV基因组拷贝,转染后它可以在293T及HepG2细胞中转录出所有的病毒RNAs,翻译出病毒蛋白。转染3天后通过ELISA检测培养液上清中乙型肝炎病毒表面抗原的表达量降低了 90%。通过MTT实验,在转然后48小时,我们发现CRISPR/Cas9系统对细胞几乎没有任何毒性。这些数据表明CRISPR/Cas9系统可以在体外特异性地敲除HBV复制模板cccDNA,预示着CRISPR/Cas9系统具有清除HBV感染的潜能。
其他文献
【摘要】C语言课程作为我国高校进行计算机教学的基础计算机语言课程,是我国教育部规定的高校必修课程,以提高学生的计算机C语言理论水平与操作能力为教学目标,尤其是在电脑成为主要工作工具的信息化时代,对高校学生进行C语言教学十分必要。本文在对高校中的C语言教学存在的问题进行分析的基础上,对高校的C语言教学模式的改革提出几点建议。  【关键词】C语言 教学模式 改革对策  【基金项目】黄冈师范学院2017
目的探讨经腋下小切口手术治疗自发性气胸的临床疗效。方法回顾分析84例经腋下小切口手术治疗自发性气胸的临床资料。结果 84例中无死亡病例,无并发症;术中出血量在(50±1
在油库经营生产过程中,输油泵在整个生产系统中是日均使用频率最高的设备,而大部分采用星三角起动,造成油泵轴承磨损加速和噪声增大,就改造中煤秦皇岛储运中心化奥油库输油,
针对抽风筒的结构,对其翻边成形工艺进行了分析,根据成形难点,设计了新型翻边-整形复合模,解决了用传统翻边模翻边工序多,生产周期长的问题,保证了产品质量要求,提高了生产效
目的探讨造血干细胞移植后早期感染的预防及护理对策。方法对2009年1月-2009年12月在我科接受外周血造血干细胞移植治疗的113例患者临床资料和对早期感染的预防及护理措施进
【摘 要】新课标下的语文教学中的对话,是指师生、生生基于相互尊重、信任和平等立场,通过言谈和倾听而进行的双向沟通合作的方式。  【关键词】新课程标准;对话  【中图分类号】G633.3 【文献标识码】A  【文章编号】2095-3089(2018)15-0137-02  新课标明确提出:“阅读教学是学生,教师,文本之间对话的过程。”“教师是教学活动的组织者和引导者,语文教学应在师生平等的对话过程中
目的:软骨缺损治疗的难点在于软骨组织难以进行自主修复。本研究旨在探讨槲皮素对于软骨细胞增殖能力、表型维持的影响,并进一步探讨其对细胞内信号通路调控的分子学机制,为