直扩RPA核酸即时可视化检测技术研究

来源 :上海师范大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:baochangjingmao
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重组酶聚合酶扩增技术(Recombinase Polymerase Amplification,RPA)是利用重组酶和单链结合蛋白在常温下协同实现引物与模板的特异结合,以代替传统PCR热循环中的变性和复性过程的新型恒温体外核酸扩增技术。本研究基于RPA技术建立了转基因玉米TC1507的检测方法,可在36.7℃恒温条件下快速检测到转基因玉米TC1507中的保守区段,具有较好的特异性,其检测灵敏度达到了10-2ng/μL,检测时间只需5分钟,适用于基层实验室及现场快速检测转基因玉米TC1507及其制品;此外,对于金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SAU),建立了一种基于重组酶聚合酶介导的等温扩增技术(RPA)快速检测金黄色葡萄球菌的方法。方法根据金黄色葡萄球菌基因保守序列设计的2对引物,以金黄色葡萄球菌阳性菌株和其他7种非金黄色葡萄球菌基因组DNA为模板,考察该方法的检测灵敏度和特异性。结果RPA快速检测金黄色葡萄球菌方法仅需5 min,检测灵敏度为101cfu/μL;7种非金黄色葡萄球菌均不能扩增,特异性较强。本研究建立了金黄色葡萄球菌的RPA快速检测方法,具有快速,简单,成本较低等优点,为金黄色葡萄球菌的快速检测提供一个新的工具;大麦黄花叶病毒(Barley yellow mosaic virus,Ba YMV)是一种在全世界广泛分布并且破坏性极大的植物病毒,可以导致大麦产量骤减以及种质的衰退。为此,建立了快速灵敏的一步法逆转录重组酶聚合酶扩增检测技术(RT-RPA)。根据Gen Bank数据库中Ba YMV的保守区基因序列,设计RPA特异性引物,采用Ba YMV,Ba MMV,BSMV,BYDV,BYSMV,BMMV,WSBMV,WSMV以及NCMV共8种病毒进行RT-RPA特异性验证;并设计5个模板浓度梯度,验证RT-RPA方法的灵敏性,并对RT-RPA和RT-PCR的灵敏度进行比较。结果显示,建立的RT-RPA检测方法能够从Ba YMV样品中检测到特异性条带;特异性验证试验表明除Ba YMV能检测到特异性条带以外,其他7种病毒均未检测到条带;RT-RPA检测Ba YMV的灵敏度达到10-3ng/μL,且灵敏度高于RT-PCR,检测时间只需8分钟。综上所述,本研究建立的RT-RPA方法检测Ba YMV特异性强,灵敏度高,无需特殊的仪器设备,适合实验室或者现场快速检测。
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