2016年一号文件《关于落实发展新理念加快农业现代化实现全面小康目标的若干意见》是中央一号文件自2004年以来连续13次强调“三农问题”。农村社会的发展对于中国全面发展的重要性不言而喻。为适应新的市场竞争不断对农村集体经济组织治理结构提出的新的挑战,我国的农村社会经历了合作社、人民公社、经济合作社三个主要阶段的演变,直到现阶段多种农村合作经济组织的多元共存。农村集体经济组织作为农村经济社会的重要组成部分,学术界已从农村集体经济组织产权制度的改革、法律地位和成员权的界定等角度进行了大量研究并获得成果。而针对如何有效改善经济组织的治理结构,提高农村集体经济组织的经济效益,促进农村与城镇协调发展的研究还较少。本文运用调研走访、理论研究、文献梳理和数据分析等方法,分析了农村集体经济组织治理结构对组织经济绩效的影响机制,并结合农村集体经济组织的实际情况提出可行的政策建议。本文先介绍了农村集体经济组织的发展历程,并结合现代成熟的公司治理理论对农村集体经济组织治理结构的进行研究。为研究治理结构与组织经济绩效的关系,通过对集权与分权理论、高阶梯队理论和委托代理理论等有关理论的整理,得出农村集体经济组织治理结构中集权度、管理人员异质性和监督机制三个维度。对农村集体经济组织治理结构对组织经济绩效的影响进行了理论分析,并提出相关假设。通过文献整理梳理出对组织经济绩效产生影响的主要因素,经过实地调研获取有关数据。以广东省的农村集体经济组织作为研究对象,用SPSS19.0软件对广东省110个的农村集体经济组织的调研数据进行分析,发现农村集体经济组织集权度对组织的绩效成负相关,一人多职的情况过高对应了较低的组织经济增长率;而管理人员的个人特征也会对组织绩效产生影响,如平均年龄和平均学历水平越高,对组织的收入增长率有促进作用;而不同角度的监督制度安排对经济增长率呈现双向的影响,如组织的年开会次数和财务信息披露的程度越高,意味着有着更高的收入增长率,而财务负责人独立性越高反而与组织的收入增长率负相关。