猪PPARδ基因5'上游调控区SNP与脂肪沉积性状相关性及其功能初步分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:frankyfeng
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
猪7号染色体存在显著影响背膘厚等脂肪沉积性状的数量性状座位(quantitative trait locus,QTL),氧化物酶增殖体激活受体δ(Peroxisome Proliferators-Activated Receptorδ,PPARδ)在调控脂肪生成和脂肪酸氧化过程中起重要作用,被认为是猪7号染色体背膘厚QTL区域最重要的位置功能候选基因。本研究选取了PPARδ基因转录起始位点5′端上游2100bp调控区序列进行了单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)筛选和转录活性研究,取得了以下结果:  1.通过对大白猪和梅山猪PPARδ上游调控区进行比较测序,发现在该基因转录起始位点上游655bp处存在G/A碱基突变,利用PCR-EcoRⅠ-RFLP方法建立了检测该位点多态性的方法,在中外10个不同猪种中进行了多态性验证和等位基因频率分析;在大白×梅山F2代资源群体和梅山猪群中对该SNP与胴体性状进行关联分析,发现该位点与背膘厚、胴体长、板油重等胴体性状显著相关,其中携带GG基因型个体的背膘厚平均值都要显著高于AA基因型个体。  2.利用Tess和promoter等软件对PPARδ基因2100bp的启动子区进行转录因子结合位点的预测,根据这些转录因子具体位置,设计了七段缺失片段,在C2C12﹑PK细胞中进行了转录活性分析,结果发现在转录起始位点上游100bp处的活性是最高的,而之后的活性要明显偏低,表明转录起始位点上游100bp处可能是核心启动子区;同时构建了携带A/G等位基因的启动子片段,转录活性试验发现在猪PK细胞、小鼠C2C12细胞中G→A突变分别导致了该区域转录活性下降了5.15和4.07倍,生物信息学分析表明该碱基突变导致了转录因子INO2和NBF结合位点的改变。
其他文献
奇异地形奇异风俗rn智利国土从北到南跨越39个纬度,距离4300多千米,和我国黑龙江到南沙群岛的距离差不多.而从东到西却非常狭窄,最窄的地方还不到100千米,最宽处也不过300多
期刊
在今年初的学校联欢会上,乔乔木和可乐王凭借一段《你会吃吗》的相声赢得了阵阵笑声.不少同学告乔乔木,这段相声不仅好玩,还教会了他们很多关于”吃”的用法.这让乔乔木有点
期刊
催乳素基因可能是影响家鸡产蛋性能的重要候选基因.该研究以产蛋性能具有明显差异的4个鸡品种(莱航鸡、阳山鸡、丝羽乌骨鸡和隐性白洛克鸡)和农大褐蛋鸡×丝羽乌骨鸡3代参考
每次吃香蕉时,香蕉皮都被丢到一边,实在是太可惜了!仔细看看,香蕉皮那亮丽的色调,易剥、易剪、易撕、易弯曲的特性,以及内外皮明显的色差与质地区别多么令人喜爱,这不就是最
期刊
目的 探讨PI3K/GSK-3通路在溶血磷脂酸(LPA)诱导PC12细胞凋亡中的作用.方法 培养PC12细胞,CCK8测定不同水平LPA处理下PC12细胞的细胞活力,Tunel法测定不同水平LPA处理下PC12
随着养羊业的飞快发展,人们越来越注重羊肉的品质。骨骼肌肌纤维的组织学结构特征是决定肉品质的关键因素之一。其中,胎儿期肌纤维的数量和直径影响着骨骼肌终生的生长发育进而
今年夏天实在是太热了,开空调不环保,电风扇吹出来的又都是热风,起不到凉爽的作用.这可怎么办呢?有了,就让我自己做个“小空调”吧.rn制作准备rn一台电风扇、一条浴巾、一个
期刊
我们的任务rn我们是中国儿童中心《学与玩》的小记者.不过这次,编辑姐姐给我们安排的工作更像是讲解员.我们将把在大栅栏的所见所闻和我们做的“功课”传递给全国的同龄人.请
期刊
通过对尖山铁矿高溜井运矿方式的分析和观察,总结了溜井生产中的经验和教训,根据矿石在溜井内的移动规律,探讨了尖山铁矿溜井生产管理方法。 Through the analysis and observa
本项研究目的就是利用现代分子技术寻找影响猪产仔数的标记基因座,为应用标记辅助选择培育高繁殖率猪的品种或品系提供依据。试验主要通过PCR-RFLP技术研究猪ob基因第3348bp到