哈氏噬纤维菌的Tn4351插入突变及突变子筛选与分析

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yzlang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
哈氏噬纤维菌(Cytophaga hutchinsonii)是一类广泛分布的降解纤维素细菌,由于其能独特的高效降解结晶纤维素而被美国能源部列入微生物基因组研究计划,并于2005年完成了全基因组序列的测定。 哈氏噬纤维菌虽然能在贫瘠的环境中迅速彻底地降解结晶纤维素,但是却不易在葡萄糖碳源琼脂平板上生长,生长条件特殊,能利用的可溶性碳源范围狭窄,所以对其纤维素降解机制的研究主要停留在表面现象,一直很难深入研究。本论文通过利用单独灭菌或过滤除菌的葡萄糖做碳源,降低琼脂浓度的方法,使哈氏噬纤维菌在琼脂平板上生长条件得到改善。哈氏噬纤维菌在0.5%agar,0.22μm微孔滤膜过滤或者115℃,30min高压灭菌的葡萄糖为碳源的平板上能够长出单菌落。这为哈氏噬纤维菌的下一步研究提供了有利条件。 本论文优化了哈氏噬纤维菌的遗传转化操作系统,对多个影响哈氏噬纤维菌遗传操作的因素进行了探索。在接合的过程中,感受态细胞的制备是一个关键因素,渗透压,接合的时间和温度都影响转化效率。以对数中期的细胞为感受态细胞,生理盐水或者 TC buffer 洗涤细胞,28℃接合24h,转化效率达到1.5×10-6左右。这种接合方式是建立在优化了平板生长条件的基础上,克服了在滤纸上生长的局限性,能得到大量的突变子。本论文利用转座子Tn4351随机插入突变建立了一个突变子库。目前大约有1000个菌株。 对纤维素的高效降解是哈氏噬纤维菌的一个明显特征,本论文根据该菌在葡萄糖和纤维素平板上生长现象的不同,设计了一种混合碳源筛选平板(0.05%GLUCOSE+1%CF-11),根据透明圈的大小或不产透明圈可以筛选得到纤维素降解能力减弱或不能降解纤维素的菌株。另外发现0.05%葡萄糖的添加也促进了哈氏噬纤维菌的生长,该方法减少了传统缺陷菌株筛选方法的烦琐过程,提高了筛选效率。 根据是否降解纤维素,CMC酶活测定和完全降解滤纸的时间等方法发现两株纤维素降解能力降低的菌株27号和31号突变子。其中27号突变子酶活降低20.7%,滤纸降解时间比哈氏噬纤维菌慢一个星期左右。通过DNAMAN,BLAST等软件对其进行了序列分析,发现27号突变子属于还未确定功能的蛋白的插入失活体,该蛋白在纤维素降解中是否起作用以及如何起作用,还需进一步实验证明。31号突变子酶活降低40.7%,滤纸降解时间比哈氏噬纤维菌慢13天左右。通过DNAMAN,BLAST等软件对其进行了序列分析,发现31号突变子属于还未确定功能的蛋白的插入失活体,预测是一种分泌性蛋白,是否是哈氏嗜纤维菌纤维素酶系的组成部分之一还有待于验证。 滑动性是哈氏噬纤维菌的另一个重要特性,也是本论文筛选的突变子特性之一。 本论文筛选得到两株滑动性增强的突变子39号和212号突变子,其中39号突变子从表观现象上看,CMC内切酶活升高25.08%,从而从一方面表明哈氏噬纤维菌的多糖利用与其滑动性相关。39号突变子属于一种转录调节因子的失活突变体。其滑动现象类似于粘细菌的S型滑动。212号突变子能够降解滤纸。212号突变子属于DNA解旋酶超家族I失活突变体。212号突变子滑动性类似于粘细菌的A型滑动。 这些突变子的发现对我们进一步研究哈氏噬纤维菌的纤维素降解机制,滑动机制以及其纤维素降解与滑动性之间的关系具有重要意义。
其他文献
“兴趣是最好的老师”,这是因为兴趣是求知的内在动力,激发起了学生的兴趣,学习就会变得积极主动,学得轻松且富有成效.但学习兴趣不是天生的,要依靠各科教师培养、引导和激发
土壤线虫是土壤生态系统中极为丰富的后生动物,也是土壤动物中重要的功能类群,它们在各种生境的土壤中分布都很广泛,数量多达7.6×105-9.2×106条/m2。因农田食物环境更有利
“在整个世界里,有什么地方还能有如此的景色,等待着摄影家和探险家……”美籍奥地利探险家约瑟夫·洛克在1928年的《贡嘎岭香巴拉,世外桃源圣地》中这样写道。这个让世界惊艳的地方就是四川省甘孜藏族自治州的稻城。  稻城,古名“稻坝”,藏语意为山谷沟口开阔之地。东汉为白狼羌地,唐属吐蕃,元属吐蕃等路宣慰司,明属朵甘都司,清属理塘土司。清光绪三十三年(1911),正式核准置“稻成县”,隶康定府。之所以叫“
期刊
格林-巴利综合征(Guillain-Barre’Syndrome,GBS)又称急性炎性脱髓鞘性多神经病(acute Inflammatory demyelinating polyneuropathy,AIDP),是累及周围神经(peripheral nervou
紫草素是传统中药紫草里的主要有效活性成分,药理研究表明紫草素具有多种生物学活性,并且紫草素还是良好的天然色素,已广泛用于食品、化妆品和印染工业中,需求量巨大。随着人们的大量采集,目前已接近枯竭,因此,引起各地的化学家对紫草素全合成进行研究。本论文以2,5-二甲氧基苯甲醛为原料出发,经过Stobbe缩合和环化以及LiAlH_4还原得到4-羟基-5,8-二甲氧基-萘-2-甲醇,再对比了几种氧化方法,使
开放式的教学模式能够提高学生们学习数学的积极性和主动性,能够带来学生们充分的交流互动空间,进而培养学生们的数学逻辑思维.此文便是以小学数学中的开放式教学模式为基础,
输入土壤中的有机物料能够显著影响土壤肥力的维持和生物群落的发展,而且有机物料在土壤中的不均匀分布加剧了土壤空间异质性,影响土壤生物群落的结构和功能,而有关有机物料
欢迎百度:一品布衣马金辉新浪博客大家评说马金辉看一画得一悟。—作家徐光耀金辉:从《渤海潮》上读到《向乡亲们汇报》,文图都率性,大境现端倪。读后特问候,并望瞄着一只兔
随着新课程标准的实施,让我感受到地理教学改革正迈着坚实的步伐前进着.为了改变过去课堂气氛沉闷,学生被动接受的状态,更好的体现学生的主体作用,如何设计课堂教学是至关重
核糖体失活蛋白(RIP)是一类广泛存在于植物界中的毒蛋白。由于其对人类和动物细胞具有独特的生物活性和对治疗艾滋病、癌症等具有潜在的应用价值,从而引起了人们极大的兴趣。